Protein–RNA interactions for Protein: Q5T124

UBXN11, UBX domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN11Q5T124 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
UBXN11Q5T124 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
UBXN11Q5T124 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
UBXN11Q5T124 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
UBXN11Q5T124 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBXN11Q5T124 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBXN11Q5T124 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBXN11Q5T124 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBXN11Q5T124 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBXN11Q5T124 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBXN11Q5T124 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBXN11Q5T124 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBXN11Q5T124 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBXN11Q5T124 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBXN11Q5T124 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBXN11Q5T124 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBXN11Q5T124 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBXN11Q5T124 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
UBXN11Q5T124 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBXN11Q5T124 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBXN11Q5T124 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
UBXN11Q5T124 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
UBXN11Q5T124 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
UBXN11Q5T124 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBXN11Q5T124 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBXN11Q5T124 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
UBXN11Q5T124 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
UBXN11Q5T124 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
UBXN11Q5T124 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
UBXN11Q5T124 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBXN11Q5T124 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBXN11Q5T124 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBXN11Q5T124 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBXN11Q5T124 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBXN11Q5T124 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBXN11Q5T124 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBXN11Q5T124 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBXN11Q5T124 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBXN11Q5T124 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBXN11Q5T124 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBXN11Q5T124 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBXN11Q5T124 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBXN11Q5T124 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBXN11Q5T124 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBXN11Q5T124 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBXN11Q5T124 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBXN11Q5T124 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBXN11Q5T124 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBXN11Q5T124 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBXN11Q5T124 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
UBXN11Q5T124 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBXN11Q5T124 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
UBXN11Q5T124 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
UBXN11Q5T124 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
UBXN11Q5T124 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBXN11Q5T124 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBXN11Q5T124 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBXN11Q5T124 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBXN11Q5T124 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBXN11Q5T124 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBXN11Q5T124 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
UBXN11Q5T124 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBXN11Q5T124 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
UBXN11Q5T124 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBXN11Q5T124 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBXN11Q5T124 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBXN11Q5T124 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBXN11Q5T124 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
UBXN11Q5T124 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBXN11Q5T124 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBXN11Q5T124 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBXN11Q5T124 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBXN11Q5T124 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBXN11Q5T124 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
UBXN11Q5T124 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBXN11Q5T124 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBXN11Q5T124 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBXN11Q5T124 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBXN11Q5T124 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBXN11Q5T124 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBXN11Q5T124 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBXN11Q5T124 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBXN11Q5T124 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBXN11Q5T124 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBXN11Q5T124 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBXN11Q5T124 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBXN11Q5T124 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBXN11Q5T124 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBXN11Q5T124 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBXN11Q5T124 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBXN11Q5T124 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBXN11Q5T124 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBXN11Q5T124 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
UBXN11Q5T124 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBXN11Q5T124 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBXN11Q5T124 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
UBXN11Q5T124 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBXN11Q5T124 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
UBXN11Q5T124 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBXN11Q5T124 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms