Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ70

SPDYA, Speedy protein A, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYAQ5MJ70 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPDYAQ5MJ70 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPDYAQ5MJ70 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPDYAQ5MJ70 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPDYAQ5MJ70 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPDYAQ5MJ70 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPDYAQ5MJ70 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPDYAQ5MJ70 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPDYAQ5MJ70 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SPDYAQ5MJ70 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPDYAQ5MJ70 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPDYAQ5MJ70 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPDYAQ5MJ70 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPDYAQ5MJ70 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPDYAQ5MJ70 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPDYAQ5MJ70 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPDYAQ5MJ70 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPDYAQ5MJ70 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPDYAQ5MJ70 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPDYAQ5MJ70 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SPDYAQ5MJ70 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPDYAQ5MJ70 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPDYAQ5MJ70 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPDYAQ5MJ70 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPDYAQ5MJ70 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPDYAQ5MJ70 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPDYAQ5MJ70 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPDYAQ5MJ70 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPDYAQ5MJ70 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SPDYAQ5MJ70 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPDYAQ5MJ70 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SPDYAQ5MJ70 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SPDYAQ5MJ70 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPDYAQ5MJ70 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPDYAQ5MJ70 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPDYAQ5MJ70 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPDYAQ5MJ70 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPDYAQ5MJ70 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPDYAQ5MJ70 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPDYAQ5MJ70 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPDYAQ5MJ70 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPDYAQ5MJ70 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPDYAQ5MJ70 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPDYAQ5MJ70 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPDYAQ5MJ70 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPDYAQ5MJ70 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPDYAQ5MJ70 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPDYAQ5MJ70 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPDYAQ5MJ70 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPDYAQ5MJ70 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SPDYAQ5MJ70 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SPDYAQ5MJ70 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPDYAQ5MJ70 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPDYAQ5MJ70 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPDYAQ5MJ70 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPDYAQ5MJ70 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPDYAQ5MJ70 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPDYAQ5MJ70 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPDYAQ5MJ70 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SPDYAQ5MJ70 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPDYAQ5MJ70 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPDYAQ5MJ70 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPDYAQ5MJ70 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPDYAQ5MJ70 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPDYAQ5MJ70 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPDYAQ5MJ70 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPDYAQ5MJ70 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPDYAQ5MJ70 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPDYAQ5MJ70 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPDYAQ5MJ70 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPDYAQ5MJ70 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPDYAQ5MJ70 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPDYAQ5MJ70 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPDYAQ5MJ70 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPDYAQ5MJ70 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SPDYAQ5MJ70 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPDYAQ5MJ70 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPDYAQ5MJ70 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SPDYAQ5MJ70 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPDYAQ5MJ70 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPDYAQ5MJ70 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPDYAQ5MJ70 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPDYAQ5MJ70 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPDYAQ5MJ70 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPDYAQ5MJ70 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SPDYAQ5MJ70 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPDYAQ5MJ70 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SPDYAQ5MJ70 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SPDYAQ5MJ70 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPDYAQ5MJ70 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPDYAQ5MJ70 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPDYAQ5MJ70 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPDYAQ5MJ70 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPDYAQ5MJ70 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPDYAQ5MJ70 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPDYAQ5MJ70 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPDYAQ5MJ70 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPDYAQ5MJ70 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPDYAQ5MJ70 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPDYAQ5MJ70 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms