Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEP78Q5JTW2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEP78Q5JTW2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEP78Q5JTW2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP78Q5JTW2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP78Q5JTW2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP78Q5JTW2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP78Q5JTW2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP78Q5JTW2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP78Q5JTW2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP78Q5JTW2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP78Q5JTW2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEP78Q5JTW2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEP78Q5JTW2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEP78Q5JTW2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEP78Q5JTW2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEP78Q5JTW2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEP78Q5JTW2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CEP78Q5JTW2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEP78Q5JTW2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEP78Q5JTW2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEP78Q5JTW2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEP78Q5JTW2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CEP78Q5JTW2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEP78Q5JTW2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CEP78Q5JTW2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CEP78Q5JTW2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CEP78Q5JTW2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CEP78Q5JTW2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEP78Q5JTW2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CEP78Q5JTW2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEP78Q5JTW2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEP78Q5JTW2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEP78Q5JTW2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEP78Q5JTW2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEP78Q5JTW2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP78Q5JTW2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP78Q5JTW2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP78Q5JTW2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP78Q5JTW2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP78Q5JTW2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP78Q5JTW2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP78Q5JTW2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP78Q5JTW2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP78Q5JTW2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP78Q5JTW2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP78Q5JTW2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP78Q5JTW2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP78Q5JTW2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEP78Q5JTW2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEP78Q5JTW2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEP78Q5JTW2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEP78Q5JTW2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEP78Q5JTW2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEP78Q5JTW2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP78Q5JTW2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP78Q5JTW2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP78Q5JTW2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP78Q5JTW2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP78Q5JTW2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP78Q5JTW2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEP78Q5JTW2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEP78Q5JTW2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEP78Q5JTW2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEP78Q5JTW2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEP78Q5JTW2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEP78Q5JTW2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEP78Q5JTW2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CEP78Q5JTW2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEP78Q5JTW2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEP78Q5JTW2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEP78Q5JTW2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEP78Q5JTW2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEP78Q5JTW2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEP78Q5JTW2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEP78Q5JTW2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CEP78Q5JTW2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEP78Q5JTW2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CEP78Q5JTW2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEP78Q5JTW2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEP78Q5JTW2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEP78Q5JTW2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEP78Q5JTW2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEP78Q5JTW2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CEP78Q5JTW2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEP78Q5JTW2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEP78Q5JTW2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEP78Q5JTW2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP78Q5JTW2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP78Q5JTW2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP78Q5JTW2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP78Q5JTW2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP78Q5JTW2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP78Q5JTW2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP78Q5JTW2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP78Q5JTW2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP78Q5JTW2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEP78Q5JTW2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEP78Q5JTW2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEP78Q5JTW2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms