Protein–RNA interactions for Protein: Q5JS13

RALGPS1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor RalGPS1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1Q5JS13 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RALGPS1Q5JS13 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RALGPS1Q5JS13 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RALGPS1Q5JS13 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RALGPS1Q5JS13 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RALGPS1Q5JS13 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RALGPS1Q5JS13 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RALGPS1Q5JS13 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RALGPS1Q5JS13 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RALGPS1Q5JS13 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RALGPS1Q5JS13 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RALGPS1Q5JS13 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RALGPS1Q5JS13 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RALGPS1Q5JS13 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RALGPS1Q5JS13 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RALGPS1Q5JS13 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RALGPS1Q5JS13 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RALGPS1Q5JS13 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RALGPS1Q5JS13 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RALGPS1Q5JS13 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RALGPS1Q5JS13 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RALGPS1Q5JS13 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RALGPS1Q5JS13 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RALGPS1Q5JS13 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RALGPS1Q5JS13 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RALGPS1Q5JS13 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RALGPS1Q5JS13 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RALGPS1Q5JS13 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RALGPS1Q5JS13 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RALGPS1Q5JS13 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RALGPS1Q5JS13 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RALGPS1Q5JS13 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RALGPS1Q5JS13 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RALGPS1Q5JS13 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RALGPS1Q5JS13 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RALGPS1Q5JS13 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RALGPS1Q5JS13 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RALGPS1Q5JS13 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RALGPS1Q5JS13 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RALGPS1Q5JS13 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RALGPS1Q5JS13 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RALGPS1Q5JS13 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RALGPS1Q5JS13 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RALGPS1Q5JS13 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RALGPS1Q5JS13 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RALGPS1Q5JS13 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RALGPS1Q5JS13 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RALGPS1Q5JS13 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RALGPS1Q5JS13 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RALGPS1Q5JS13 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RALGPS1Q5JS13 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RALGPS1Q5JS13 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RALGPS1Q5JS13 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RALGPS1Q5JS13 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RALGPS1Q5JS13 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RALGPS1Q5JS13 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RALGPS1Q5JS13 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RALGPS1Q5JS13 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RALGPS1Q5JS13 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RALGPS1Q5JS13 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RALGPS1Q5JS13 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RALGPS1Q5JS13 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RALGPS1Q5JS13 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RALGPS1Q5JS13 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RALGPS1Q5JS13 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RALGPS1Q5JS13 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RALGPS1Q5JS13 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RALGPS1Q5JS13 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RALGPS1Q5JS13 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RALGPS1Q5JS13 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RALGPS1Q5JS13 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RALGPS1Q5JS13 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RALGPS1Q5JS13 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RALGPS1Q5JS13 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RALGPS1Q5JS13 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RALGPS1Q5JS13 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RALGPS1Q5JS13 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RALGPS1Q5JS13 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RALGPS1Q5JS13 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RALGPS1Q5JS13 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RALGPS1Q5JS13 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RALGPS1Q5JS13 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RALGPS1Q5JS13 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RALGPS1Q5JS13 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RALGPS1Q5JS13 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RALGPS1Q5JS13 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RALGPS1Q5JS13 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RALGPS1Q5JS13 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RALGPS1Q5JS13 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RALGPS1Q5JS13 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RALGPS1Q5JS13 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RALGPS1Q5JS13 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RALGPS1Q5JS13 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RALGPS1Q5JS13 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RALGPS1Q5JS13 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RALGPS1Q5JS13 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RALGPS1Q5JS13 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RALGPS1Q5JS13 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RALGPS1Q5JS13 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RALGPS1Q5JS13 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms