Protein–RNA interactions for Protein: Q5H9E4

SLC25A53, Solute carrier family 25 member 53, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A53Q5H9E4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC25A53Q5H9E4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC25A53Q5H9E4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC25A53Q5H9E4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC25A53Q5H9E4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC25A53Q5H9E4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC25A53Q5H9E4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC25A53Q5H9E4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC25A53Q5H9E4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC25A53Q5H9E4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC25A53Q5H9E4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC25A53Q5H9E4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC25A53Q5H9E4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC25A53Q5H9E4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC25A53Q5H9E4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC25A53Q5H9E4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC25A53Q5H9E4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC25A53Q5H9E4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC25A53Q5H9E4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC25A53Q5H9E4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC25A53Q5H9E4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC25A53Q5H9E4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC25A53Q5H9E4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC25A53Q5H9E4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC25A53Q5H9E4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC25A53Q5H9E4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC25A53Q5H9E4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC25A53Q5H9E4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC25A53Q5H9E4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC25A53Q5H9E4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC25A53Q5H9E4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC25A53Q5H9E4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC25A53Q5H9E4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC25A53Q5H9E4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC25A53Q5H9E4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC25A53Q5H9E4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC25A53Q5H9E4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC25A53Q5H9E4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC25A53Q5H9E4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC25A53Q5H9E4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC25A53Q5H9E4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC25A53Q5H9E4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC25A53Q5H9E4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SLC25A53Q5H9E4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC25A53Q5H9E4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC25A53Q5H9E4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC25A53Q5H9E4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC25A53Q5H9E4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC25A53Q5H9E4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC25A53Q5H9E4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC25A53Q5H9E4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC25A53Q5H9E4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC25A53Q5H9E4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC25A53Q5H9E4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC25A53Q5H9E4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC25A53Q5H9E4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC25A53Q5H9E4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC25A53Q5H9E4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC25A53Q5H9E4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC25A53Q5H9E4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC25A53Q5H9E4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC25A53Q5H9E4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC25A53Q5H9E4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC25A53Q5H9E4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC25A53Q5H9E4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC25A53Q5H9E4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC25A53Q5H9E4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC25A53Q5H9E4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC25A53Q5H9E4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC25A53Q5H9E4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC25A53Q5H9E4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC25A53Q5H9E4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC25A53Q5H9E4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC25A53Q5H9E4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC25A53Q5H9E4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC25A53Q5H9E4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC25A53Q5H9E4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC25A53Q5H9E4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC25A53Q5H9E4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC25A53Q5H9E4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC25A53Q5H9E4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC25A53Q5H9E4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC25A53Q5H9E4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC25A53Q5H9E4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC25A53Q5H9E4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC25A53Q5H9E4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC25A53Q5H9E4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC25A53Q5H9E4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC25A53Q5H9E4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC25A53Q5H9E4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC25A53Q5H9E4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC25A53Q5H9E4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC25A53Q5H9E4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC25A53Q5H9E4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC25A53Q5H9E4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC25A53Q5H9E4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC25A53Q5H9E4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC25A53Q5H9E4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC25A53Q5H9E4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC25A53Q5H9E4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms