Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH76

XKR4, XK-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR4Q5GH76 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
XKR4Q5GH76 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
XKR4Q5GH76 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
XKR4Q5GH76 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
XKR4Q5GH76 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
XKR4Q5GH76 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
XKR4Q5GH76 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
XKR4Q5GH76 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
XKR4Q5GH76 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
XKR4Q5GH76 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
XKR4Q5GH76 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
XKR4Q5GH76 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
XKR4Q5GH76 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
XKR4Q5GH76 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
XKR4Q5GH76 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
XKR4Q5GH76 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
XKR4Q5GH76 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
XKR4Q5GH76 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
XKR4Q5GH76 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
XKR4Q5GH76 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
XKR4Q5GH76 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
XKR4Q5GH76 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
XKR4Q5GH76 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
XKR4Q5GH76 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
XKR4Q5GH76 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
XKR4Q5GH76 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
XKR4Q5GH76 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
XKR4Q5GH76 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
XKR4Q5GH76 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
XKR4Q5GH76 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
XKR4Q5GH76 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
XKR4Q5GH76 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
XKR4Q5GH76 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
XKR4Q5GH76 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
XKR4Q5GH76 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
XKR4Q5GH76 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
XKR4Q5GH76 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
XKR4Q5GH76 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
XKR4Q5GH76 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
XKR4Q5GH76 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
XKR4Q5GH76 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
XKR4Q5GH76 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
XKR4Q5GH76 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
XKR4Q5GH76 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
XKR4Q5GH76 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
XKR4Q5GH76 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
XKR4Q5GH76 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
XKR4Q5GH76 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
XKR4Q5GH76 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
XKR4Q5GH76 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
XKR4Q5GH76 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
XKR4Q5GH76 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
XKR4Q5GH76 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
XKR4Q5GH76 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
XKR4Q5GH76 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
XKR4Q5GH76 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
XKR4Q5GH76 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
XKR4Q5GH76 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
XKR4Q5GH76 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
XKR4Q5GH76 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
XKR4Q5GH76 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
XKR4Q5GH76 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
XKR4Q5GH76 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
XKR4Q5GH76 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
XKR4Q5GH76 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
XKR4Q5GH76 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
XKR4Q5GH76 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
XKR4Q5GH76 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
XKR4Q5GH76 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
XKR4Q5GH76 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
XKR4Q5GH76 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
XKR4Q5GH76 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
XKR4Q5GH76 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
XKR4Q5GH76 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
XKR4Q5GH76 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
XKR4Q5GH76 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
XKR4Q5GH76 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
XKR4Q5GH76 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
XKR4Q5GH76 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
XKR4Q5GH76 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
XKR4Q5GH76 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
XKR4Q5GH76 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
XKR4Q5GH76 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
XKR4Q5GH76 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
XKR4Q5GH76 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
XKR4Q5GH76 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
XKR4Q5GH76 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
XKR4Q5GH76 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
XKR4Q5GH76 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
XKR4Q5GH76 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
XKR4Q5GH76 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
XKR4Q5GH76 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
XKR4Q5GH76 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
XKR4Q5GH76 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
XKR4Q5GH76 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
XKR4Q5GH76 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
XKR4Q5GH76 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
XKR4Q5GH76 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
XKR4Q5GH76 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
XKR4Q5GH76 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms