Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBN2

TRIM61, Putative tripartite motif-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM61Q5EBN2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM61Q5EBN2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM61Q5EBN2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM61Q5EBN2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM61Q5EBN2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM61Q5EBN2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM61Q5EBN2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM61Q5EBN2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM61Q5EBN2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM61Q5EBN2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM61Q5EBN2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM61Q5EBN2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM61Q5EBN2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM61Q5EBN2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM61Q5EBN2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM61Q5EBN2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM61Q5EBN2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM61Q5EBN2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM61Q5EBN2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM61Q5EBN2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM61Q5EBN2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM61Q5EBN2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM61Q5EBN2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM61Q5EBN2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRIM61Q5EBN2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRIM61Q5EBN2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRIM61Q5EBN2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRIM61Q5EBN2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM61Q5EBN2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM61Q5EBN2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM61Q5EBN2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM61Q5EBN2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM61Q5EBN2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM61Q5EBN2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM61Q5EBN2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM61Q5EBN2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM61Q5EBN2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM61Q5EBN2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM61Q5EBN2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM61Q5EBN2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM61Q5EBN2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM61Q5EBN2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM61Q5EBN2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM61Q5EBN2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM61Q5EBN2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM61Q5EBN2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM61Q5EBN2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM61Q5EBN2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM61Q5EBN2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM61Q5EBN2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM61Q5EBN2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM61Q5EBN2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM61Q5EBN2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM61Q5EBN2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM61Q5EBN2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM61Q5EBN2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM61Q5EBN2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM61Q5EBN2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM61Q5EBN2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM61Q5EBN2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM61Q5EBN2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM61Q5EBN2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM61Q5EBN2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM61Q5EBN2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM61Q5EBN2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM61Q5EBN2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM61Q5EBN2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM61Q5EBN2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM61Q5EBN2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM61Q5EBN2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM61Q5EBN2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM61Q5EBN2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM61Q5EBN2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM61Q5EBN2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM61Q5EBN2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM61Q5EBN2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM61Q5EBN2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM61Q5EBN2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM61Q5EBN2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM61Q5EBN2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM61Q5EBN2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM61Q5EBN2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM61Q5EBN2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM61Q5EBN2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM61Q5EBN2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM61Q5EBN2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM61Q5EBN2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM61Q5EBN2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM61Q5EBN2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM61Q5EBN2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM61Q5EBN2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM61Q5EBN2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM61Q5EBN2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM61Q5EBN2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM61Q5EBN2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM61Q5EBN2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM61Q5EBN2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM61Q5EBN2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM61Q5EBN2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM61Q5EBN2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms