Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZHG4

FNDC1, Fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC1Q4ZHG4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FNDC1Q4ZHG4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FNDC1Q4ZHG4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
FNDC1Q4ZHG4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FNDC1Q4ZHG4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FNDC1Q4ZHG4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FNDC1Q4ZHG4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FNDC1Q4ZHG4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FNDC1Q4ZHG4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FNDC1Q4ZHG4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FNDC1Q4ZHG4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FNDC1Q4ZHG4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FNDC1Q4ZHG4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
FNDC1Q4ZHG4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FNDC1Q4ZHG4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FNDC1Q4ZHG4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FNDC1Q4ZHG4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FNDC1Q4ZHG4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FNDC1Q4ZHG4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
FNDC1Q4ZHG4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
FNDC1Q4ZHG4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FNDC1Q4ZHG4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FNDC1Q4ZHG4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FNDC1Q4ZHG4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FNDC1Q4ZHG4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FNDC1Q4ZHG4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FNDC1Q4ZHG4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FNDC1Q4ZHG4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FNDC1Q4ZHG4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FNDC1Q4ZHG4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FNDC1Q4ZHG4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FNDC1Q4ZHG4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FNDC1Q4ZHG4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FNDC1Q4ZHG4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FNDC1Q4ZHG4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FNDC1Q4ZHG4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FNDC1Q4ZHG4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FNDC1Q4ZHG4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
FNDC1Q4ZHG4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FNDC1Q4ZHG4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FNDC1Q4ZHG4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FNDC1Q4ZHG4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
FNDC1Q4ZHG4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FNDC1Q4ZHG4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FNDC1Q4ZHG4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FNDC1Q4ZHG4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
FNDC1Q4ZHG4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FNDC1Q4ZHG4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FNDC1Q4ZHG4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
FNDC1Q4ZHG4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FNDC1Q4ZHG4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FNDC1Q4ZHG4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FNDC1Q4ZHG4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FNDC1Q4ZHG4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FNDC1Q4ZHG4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FNDC1Q4ZHG4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FNDC1Q4ZHG4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
FNDC1Q4ZHG4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FNDC1Q4ZHG4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
FNDC1Q4ZHG4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FNDC1Q4ZHG4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FNDC1Q4ZHG4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FNDC1Q4ZHG4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FNDC1Q4ZHG4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FNDC1Q4ZHG4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
FNDC1Q4ZHG4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FNDC1Q4ZHG4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FNDC1Q4ZHG4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FNDC1Q4ZHG4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
FNDC1Q4ZHG4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FNDC1Q4ZHG4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FNDC1Q4ZHG4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FNDC1Q4ZHG4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
FNDC1Q4ZHG4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
FNDC1Q4ZHG4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
FNDC1Q4ZHG4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FNDC1Q4ZHG4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
FNDC1Q4ZHG4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FNDC1Q4ZHG4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FNDC1Q4ZHG4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FNDC1Q4ZHG4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FNDC1Q4ZHG4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FNDC1Q4ZHG4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FNDC1Q4ZHG4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FNDC1Q4ZHG4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FNDC1Q4ZHG4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FNDC1Q4ZHG4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
FNDC1Q4ZHG4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
FNDC1Q4ZHG4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FNDC1Q4ZHG4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FNDC1Q4ZHG4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FNDC1Q4ZHG4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FNDC1Q4ZHG4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
FNDC1Q4ZHG4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FNDC1Q4ZHG4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FNDC1Q4ZHG4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FNDC1Q4ZHG4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FNDC1Q4ZHG4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FNDC1Q4ZHG4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FNDC1Q4ZHG4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms