Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TPRNQ4KMQ1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TPRNQ4KMQ1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TPRNQ4KMQ1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TPRNQ4KMQ1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TPRNQ4KMQ1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TPRNQ4KMQ1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TPRNQ4KMQ1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TPRNQ4KMQ1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TPRNQ4KMQ1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TPRNQ4KMQ1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TPRNQ4KMQ1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
TPRNQ4KMQ1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TPRNQ4KMQ1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TPRNQ4KMQ1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TPRNQ4KMQ1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TPRNQ4KMQ1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TPRNQ4KMQ1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TPRNQ4KMQ1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TPRNQ4KMQ1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
TPRNQ4KMQ1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TPRNQ4KMQ1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TPRNQ4KMQ1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TPRNQ4KMQ1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TPRNQ4KMQ1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TPRNQ4KMQ1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TPRNQ4KMQ1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TPRNQ4KMQ1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TPRNQ4KMQ1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TPRNQ4KMQ1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TPRNQ4KMQ1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TPRNQ4KMQ1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TPRNQ4KMQ1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TPRNQ4KMQ1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TPRNQ4KMQ1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TPRNQ4KMQ1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TPRNQ4KMQ1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TPRNQ4KMQ1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TPRNQ4KMQ1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TPRNQ4KMQ1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TPRNQ4KMQ1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TPRNQ4KMQ1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TPRNQ4KMQ1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TPRNQ4KMQ1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TPRNQ4KMQ1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TPRNQ4KMQ1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TPRNQ4KMQ1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TPRNQ4KMQ1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TPRNQ4KMQ1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TPRNQ4KMQ1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TPRNQ4KMQ1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
TPRNQ4KMQ1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TPRNQ4KMQ1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TPRNQ4KMQ1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TPRNQ4KMQ1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TPRNQ4KMQ1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TPRNQ4KMQ1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TPRNQ4KMQ1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TPRNQ4KMQ1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TPRNQ4KMQ1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
TPRNQ4KMQ1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TPRNQ4KMQ1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TPRNQ4KMQ1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TPRNQ4KMQ1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TPRNQ4KMQ1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TPRNQ4KMQ1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TPRNQ4KMQ1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TPRNQ4KMQ1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TPRNQ4KMQ1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TPRNQ4KMQ1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TPRNQ4KMQ1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TPRNQ4KMQ1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TPRNQ4KMQ1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TPRNQ4KMQ1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TPRNQ4KMQ1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TPRNQ4KMQ1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TPRNQ4KMQ1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TPRNQ4KMQ1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TPRNQ4KMQ1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TPRNQ4KMQ1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TPRNQ4KMQ1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TPRNQ4KMQ1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TPRNQ4KMQ1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TPRNQ4KMQ1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TPRNQ4KMQ1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TPRNQ4KMQ1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TPRNQ4KMQ1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TPRNQ4KMQ1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
TPRNQ4KMQ1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TPRNQ4KMQ1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TPRNQ4KMQ1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TPRNQ4KMQ1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TPRNQ4KMQ1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TPRNQ4KMQ1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TPRNQ4KMQ1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TPRNQ4KMQ1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TPRNQ4KMQ1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TPRNQ4KMQ1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TPRNQ4KMQ1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TPRNQ4KMQ1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
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