Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCT1

ZNF260, Zinc finger protein 260, humanhuman

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF260Q3ZCT1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF260Q3ZCT1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF260Q3ZCT1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF260Q3ZCT1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF260Q3ZCT1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF260Q3ZCT1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF260Q3ZCT1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF260Q3ZCT1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF260Q3ZCT1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF260Q3ZCT1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF260Q3ZCT1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF260Q3ZCT1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF260Q3ZCT1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF260Q3ZCT1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF260Q3ZCT1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF260Q3ZCT1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF260Q3ZCT1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF260Q3ZCT1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF260Q3ZCT1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF260Q3ZCT1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF260Q3ZCT1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF260Q3ZCT1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF260Q3ZCT1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF260Q3ZCT1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF260Q3ZCT1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF260Q3ZCT1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF260Q3ZCT1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF260Q3ZCT1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF260Q3ZCT1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF260Q3ZCT1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF260Q3ZCT1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF260Q3ZCT1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF260Q3ZCT1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF260Q3ZCT1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF260Q3ZCT1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF260Q3ZCT1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF260Q3ZCT1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF260Q3ZCT1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF260Q3ZCT1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF260Q3ZCT1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF260Q3ZCT1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF260Q3ZCT1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF260Q3ZCT1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF260Q3ZCT1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF260Q3ZCT1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF260Q3ZCT1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF260Q3ZCT1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF260Q3ZCT1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF260Q3ZCT1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF260Q3ZCT1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF260Q3ZCT1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF260Q3ZCT1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF260Q3ZCT1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF260Q3ZCT1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF260Q3ZCT1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF260Q3ZCT1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF260Q3ZCT1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF260Q3ZCT1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF260Q3ZCT1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNF260Q3ZCT1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF260Q3ZCT1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF260Q3ZCT1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF260Q3ZCT1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF260Q3ZCT1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF260Q3ZCT1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF260Q3ZCT1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF260Q3ZCT1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF260Q3ZCT1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF260Q3ZCT1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF260Q3ZCT1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF260Q3ZCT1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF260Q3ZCT1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF260Q3ZCT1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF260Q3ZCT1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF260Q3ZCT1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF260Q3ZCT1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF260Q3ZCT1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF260Q3ZCT1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF260Q3ZCT1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF260Q3ZCT1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF260Q3ZCT1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF260Q3ZCT1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF260Q3ZCT1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF260Q3ZCT1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF260Q3ZCT1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF260Q3ZCT1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF260Q3ZCT1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF260Q3ZCT1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF260Q3ZCT1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF260Q3ZCT1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF260Q3ZCT1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF260Q3ZCT1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF260Q3ZCT1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF260Q3ZCT1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF260Q3ZCT1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ZNF260Q3ZCT1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF260Q3ZCT1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF260Q3ZCT1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF260Q3ZCT1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF260Q3ZCT1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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