Protein–RNA interactions for Protein: Q3MHD2

LSM12, Protein LSM12 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM12Q3MHD2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LSM12Q3MHD2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LSM12Q3MHD2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LSM12Q3MHD2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LSM12Q3MHD2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LSM12Q3MHD2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LSM12Q3MHD2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LSM12Q3MHD2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LSM12Q3MHD2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LSM12Q3MHD2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LSM12Q3MHD2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LSM12Q3MHD2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LSM12Q3MHD2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LSM12Q3MHD2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LSM12Q3MHD2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LSM12Q3MHD2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LSM12Q3MHD2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LSM12Q3MHD2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LSM12Q3MHD2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LSM12Q3MHD2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LSM12Q3MHD2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LSM12Q3MHD2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LSM12Q3MHD2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LSM12Q3MHD2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LSM12Q3MHD2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LSM12Q3MHD2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LSM12Q3MHD2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LSM12Q3MHD2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LSM12Q3MHD2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LSM12Q3MHD2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LSM12Q3MHD2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LSM12Q3MHD2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LSM12Q3MHD2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LSM12Q3MHD2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LSM12Q3MHD2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LSM12Q3MHD2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LSM12Q3MHD2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LSM12Q3MHD2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LSM12Q3MHD2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LSM12Q3MHD2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LSM12Q3MHD2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LSM12Q3MHD2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LSM12Q3MHD2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSM12Q3MHD2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSM12Q3MHD2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSM12Q3MHD2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSM12Q3MHD2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LSM12Q3MHD2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSM12Q3MHD2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LSM12Q3MHD2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LSM12Q3MHD2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LSM12Q3MHD2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LSM12Q3MHD2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LSM12Q3MHD2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LSM12Q3MHD2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LSM12Q3MHD2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LSM12Q3MHD2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LSM12Q3MHD2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LSM12Q3MHD2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LSM12Q3MHD2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LSM12Q3MHD2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LSM12Q3MHD2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LSM12Q3MHD2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LSM12Q3MHD2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LSM12Q3MHD2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LSM12Q3MHD2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LSM12Q3MHD2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LSM12Q3MHD2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LSM12Q3MHD2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LSM12Q3MHD2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LSM12Q3MHD2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LSM12Q3MHD2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LSM12Q3MHD2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LSM12Q3MHD2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LSM12Q3MHD2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LSM12Q3MHD2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LSM12Q3MHD2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LSM12Q3MHD2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LSM12Q3MHD2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LSM12Q3MHD2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LSM12Q3MHD2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LSM12Q3MHD2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LSM12Q3MHD2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LSM12Q3MHD2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LSM12Q3MHD2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LSM12Q3MHD2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LSM12Q3MHD2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LSM12Q3MHD2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LSM12Q3MHD2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LSM12Q3MHD2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LSM12Q3MHD2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LSM12Q3MHD2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LSM12Q3MHD2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LSM12Q3MHD2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LSM12Q3MHD2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LSM12Q3MHD2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LSM12Q3MHD2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LSM12Q3MHD2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LSM12Q3MHD2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LSM12Q3MHD2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms