Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PROX2Q3B8N5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PROX2Q3B8N5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PROX2Q3B8N5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PROX2Q3B8N5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PROX2Q3B8N5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PROX2Q3B8N5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PROX2Q3B8N5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PROX2Q3B8N5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PROX2Q3B8N5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PROX2Q3B8N5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PROX2Q3B8N5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PROX2Q3B8N5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PROX2Q3B8N5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PROX2Q3B8N5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PROX2Q3B8N5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PROX2Q3B8N5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PROX2Q3B8N5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PROX2Q3B8N5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PROX2Q3B8N5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PROX2Q3B8N5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PROX2Q3B8N5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PROX2Q3B8N5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PROX2Q3B8N5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PROX2Q3B8N5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PROX2Q3B8N5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PROX2Q3B8N5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PROX2Q3B8N5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PROX2Q3B8N5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PROX2Q3B8N5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PROX2Q3B8N5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PROX2Q3B8N5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PROX2Q3B8N5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PROX2Q3B8N5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PROX2Q3B8N5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PROX2Q3B8N5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PROX2Q3B8N5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PROX2Q3B8N5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PROX2Q3B8N5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PROX2Q3B8N5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PROX2Q3B8N5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PROX2Q3B8N5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PROX2Q3B8N5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PROX2Q3B8N5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PROX2Q3B8N5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PROX2Q3B8N5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PROX2Q3B8N5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PROX2Q3B8N5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PROX2Q3B8N5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PROX2Q3B8N5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PROX2Q3B8N5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PROX2Q3B8N5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PROX2Q3B8N5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PROX2Q3B8N5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PROX2Q3B8N5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PROX2Q3B8N5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PROX2Q3B8N5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PROX2Q3B8N5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PROX2Q3B8N5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PROX2Q3B8N5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PROX2Q3B8N5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PROX2Q3B8N5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PROX2Q3B8N5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PROX2Q3B8N5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PROX2Q3B8N5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PROX2Q3B8N5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PROX2Q3B8N5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PROX2Q3B8N5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PROX2Q3B8N5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PROX2Q3B8N5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PROX2Q3B8N5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PROX2Q3B8N5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PROX2Q3B8N5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PROX2Q3B8N5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PROX2Q3B8N5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PROX2Q3B8N5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PROX2Q3B8N5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PROX2Q3B8N5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PROX2Q3B8N5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PROX2Q3B8N5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PROX2Q3B8N5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PROX2Q3B8N5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PROX2Q3B8N5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PROX2Q3B8N5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PROX2Q3B8N5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PROX2Q3B8N5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PROX2Q3B8N5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PROX2Q3B8N5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PROX2Q3B8N5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PROX2Q3B8N5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PROX2Q3B8N5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PROX2Q3B8N5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PROX2Q3B8N5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PROX2Q3B8N5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PROX2Q3B8N5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PROX2Q3B8N5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PROX2Q3B8N5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PROX2Q3B8N5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PROX2Q3B8N5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PROX2Q3B8N5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms