Protein–RNA interactions for Protein: Q1A5X7

WHAMMP3, Putative WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WHAMMP3Q1A5X7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
WHAMMP3Q1A5X7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
WHAMMP3Q1A5X7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
WHAMMP3Q1A5X7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
WHAMMP3Q1A5X7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
WHAMMP3Q1A5X7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
WHAMMP3Q1A5X7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
WHAMMP3Q1A5X7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
WHAMMP3Q1A5X7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
WHAMMP3Q1A5X7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
WHAMMP3Q1A5X7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
WHAMMP3Q1A5X7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
WHAMMP3Q1A5X7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
WHAMMP3Q1A5X7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
WHAMMP3Q1A5X7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
WHAMMP3Q1A5X7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
WHAMMP3Q1A5X7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
WHAMMP3Q1A5X7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
WHAMMP3Q1A5X7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
WHAMMP3Q1A5X7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
WHAMMP3Q1A5X7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
WHAMMP3Q1A5X7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
WHAMMP3Q1A5X7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
WHAMMP3Q1A5X7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
WHAMMP3Q1A5X7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
WHAMMP3Q1A5X7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
WHAMMP3Q1A5X7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
WHAMMP3Q1A5X7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
WHAMMP3Q1A5X7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
WHAMMP3Q1A5X7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
WHAMMP3Q1A5X7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
WHAMMP3Q1A5X7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
WHAMMP3Q1A5X7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
WHAMMP3Q1A5X7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
WHAMMP3Q1A5X7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
WHAMMP3Q1A5X7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
WHAMMP3Q1A5X7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
WHAMMP3Q1A5X7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
WHAMMP3Q1A5X7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
WHAMMP3Q1A5X7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
WHAMMP3Q1A5X7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
WHAMMP3Q1A5X7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
WHAMMP3Q1A5X7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
WHAMMP3Q1A5X7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
WHAMMP3Q1A5X7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
WHAMMP3Q1A5X7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
WHAMMP3Q1A5X7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
WHAMMP3Q1A5X7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
WHAMMP3Q1A5X7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
WHAMMP3Q1A5X7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
WHAMMP3Q1A5X7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
WHAMMP3Q1A5X7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
WHAMMP3Q1A5X7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
WHAMMP3Q1A5X7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
WHAMMP3Q1A5X7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
WHAMMP3Q1A5X7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
WHAMMP3Q1A5X7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
WHAMMP3Q1A5X7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
WHAMMP3Q1A5X7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
WHAMMP3Q1A5X7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
WHAMMP3Q1A5X7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
WHAMMP3Q1A5X7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
WHAMMP3Q1A5X7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
WHAMMP3Q1A5X7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
WHAMMP3Q1A5X7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
WHAMMP3Q1A5X7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
WHAMMP3Q1A5X7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
WHAMMP3Q1A5X7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
WHAMMP3Q1A5X7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
WHAMMP3Q1A5X7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
WHAMMP3Q1A5X7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
WHAMMP3Q1A5X7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
WHAMMP3Q1A5X7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
WHAMMP3Q1A5X7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
WHAMMP3Q1A5X7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
WHAMMP3Q1A5X7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
WHAMMP3Q1A5X7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
WHAMMP3Q1A5X7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
WHAMMP3Q1A5X7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
WHAMMP3Q1A5X7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
WHAMMP3Q1A5X7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
WHAMMP3Q1A5X7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
WHAMMP3Q1A5X7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
WHAMMP3Q1A5X7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
WHAMMP3Q1A5X7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
WHAMMP3Q1A5X7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
WHAMMP3Q1A5X7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
WHAMMP3Q1A5X7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
WHAMMP3Q1A5X7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
WHAMMP3Q1A5X7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
WHAMMP3Q1A5X7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
WHAMMP3Q1A5X7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
WHAMMP3Q1A5X7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
WHAMMP3Q1A5X7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
WHAMMP3Q1A5X7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
WHAMMP3Q1A5X7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
WHAMMP3Q1A5X7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
WHAMMP3Q1A5X7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
WHAMMP3Q1A5X7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
WHAMMP3Q1A5X7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms