Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPROQ16827 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPROQ16827 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPROQ16827 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPROQ16827 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPROQ16827 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPROQ16827 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPROQ16827 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPROQ16827 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPROQ16827 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPROQ16827 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPROQ16827 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPROQ16827 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPROQ16827 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPROQ16827 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPROQ16827 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPROQ16827 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPROQ16827 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPROQ16827 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPROQ16827 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPROQ16827 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPROQ16827 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPROQ16827 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPROQ16827 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPROQ16827 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPROQ16827 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPROQ16827 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPROQ16827 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPROQ16827 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPROQ16827 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPROQ16827 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPROQ16827 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPROQ16827 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPROQ16827 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPROQ16827 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPROQ16827 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPROQ16827 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPROQ16827 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPROQ16827 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPROQ16827 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPROQ16827 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPROQ16827 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPROQ16827 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPROQ16827 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPROQ16827 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPROQ16827 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPROQ16827 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPROQ16827 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPROQ16827 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPROQ16827 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPROQ16827 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPROQ16827 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPROQ16827 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPROQ16827 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPROQ16827 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPROQ16827 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPROQ16827 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPROQ16827 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPROQ16827 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPROQ16827 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPROQ16827 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPROQ16827 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPROQ16827 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPROQ16827 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPROQ16827 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPROQ16827 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPROQ16827 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPROQ16827 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPROQ16827 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPROQ16827 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPROQ16827 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPROQ16827 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPROQ16827 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPROQ16827 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPROQ16827 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPROQ16827 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPROQ16827 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPROQ16827 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPROQ16827 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPROQ16827 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPROQ16827 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPROQ16827 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPROQ16827 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPROQ16827 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPROQ16827 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPROQ16827 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPROQ16827 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPROQ16827 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPROQ16827 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPROQ16827 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPROQ16827 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPROQ16827 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPROQ16827 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPROQ16827 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPROQ16827 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPROQ16827 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPROQ16827 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPROQ16827 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPROQ16827 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPROQ16827 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
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