Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GRIK5Q16478 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GRIK5Q16478 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GRIK5Q16478 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GRIK5Q16478 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GRIK5Q16478 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GRIK5Q16478 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
GRIK5Q16478 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GRIK5Q16478 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GRIK5Q16478 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GRIK5Q16478 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GRIK5Q16478 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
GRIK5Q16478 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GRIK5Q16478 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GRIK5Q16478 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GRIK5Q16478 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
GRIK5Q16478 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GRIK5Q16478 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GRIK5Q16478 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GRIK5Q16478 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GRIK5Q16478 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GRIK5Q16478 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GRIK5Q16478 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GRIK5Q16478 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GRIK5Q16478 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
GRIK5Q16478 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
GRIK5Q16478 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GRIK5Q16478 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
GRIK5Q16478 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
GRIK5Q16478 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GRIK5Q16478 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
GRIK5Q16478 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
GRIK5Q16478 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
GRIK5Q16478 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
GRIK5Q16478 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GRIK5Q16478 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
GRIK5Q16478 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GRIK5Q16478 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GRIK5Q16478 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
GRIK5Q16478 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
GRIK5Q16478 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GRIK5Q16478 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
GRIK5Q16478 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
GRIK5Q16478 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GRIK5Q16478 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GRIK5Q16478 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GRIK5Q16478 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GRIK5Q16478 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GRIK5Q16478 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GRIK5Q16478 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GRIK5Q16478 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GRIK5Q16478 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GRIK5Q16478 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GRIK5Q16478 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GRIK5Q16478 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GRIK5Q16478 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GRIK5Q16478 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GRIK5Q16478 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GRIK5Q16478 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GRIK5Q16478 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GRIK5Q16478 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GRIK5Q16478 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GRIK5Q16478 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GRIK5Q16478 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms