Protein–RNA interactions for Protein: Q15772

SPEG, Striated muscle preferentially expressed protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 3,267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEGQ15772 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPEGQ15772 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPEGQ15772 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPEGQ15772 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPEGQ15772 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPEGQ15772 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPEGQ15772 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPEGQ15772 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPEGQ15772 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPEGQ15772 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SPEGQ15772 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SPEGQ15772 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPEGQ15772 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPEGQ15772 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPEGQ15772 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPEGQ15772 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPEGQ15772 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPEGQ15772 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPEGQ15772 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPEGQ15772 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
SPEGQ15772 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPEGQ15772 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPEGQ15772 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPEGQ15772 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPEGQ15772 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPEGQ15772 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPEGQ15772 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPEGQ15772 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPEGQ15772 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPEGQ15772 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SPEGQ15772 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPEGQ15772 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPEGQ15772 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPEGQ15772 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SPEGQ15772 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPEGQ15772 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPEGQ15772 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPEGQ15772 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPEGQ15772 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPEGQ15772 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPEGQ15772 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SPEGQ15772 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPEGQ15772 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPEGQ15772 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPEGQ15772 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPEGQ15772 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPEGQ15772 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPEGQ15772 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPEGQ15772 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPEGQ15772 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SPEGQ15772 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPEGQ15772 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPEGQ15772 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPEGQ15772 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPEGQ15772 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPEGQ15772 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPEGQ15772 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPEGQ15772 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SPEGQ15772 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SPEGQ15772 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPEGQ15772 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPEGQ15772 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SPEGQ15772 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPEGQ15772 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SPEGQ15772 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPEGQ15772 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPEGQ15772 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPEGQ15772 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPEGQ15772 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPEGQ15772 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPEGQ15772 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPEGQ15772 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPEGQ15772 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPEGQ15772 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPEGQ15772 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPEGQ15772 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPEGQ15772 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPEGQ15772 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPEGQ15772 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPEGQ15772 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPEGQ15772 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPEGQ15772 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SPEGQ15772 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPEGQ15772 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPEGQ15772 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SPEGQ15772 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPEGQ15772 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPEGQ15772 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPEGQ15772 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPEGQ15772 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPEGQ15772 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPEGQ15772 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPEGQ15772 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPEGQ15772 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SPEGQ15772 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPEGQ15772 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPEGQ15772 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPEGQ15772 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPEGQ15772 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SPEGQ15772 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms