Protein–RNA interactions for Protein: Q15404

RSU1, Ras suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSU1Q15404 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RSU1Q15404 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RSU1Q15404 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RSU1Q15404 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RSU1Q15404 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RSU1Q15404 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
RSU1Q15404 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RSU1Q15404 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RSU1Q15404 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RSU1Q15404 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RSU1Q15404 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RSU1Q15404 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RSU1Q15404 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RSU1Q15404 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RSU1Q15404 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RSU1Q15404 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RSU1Q15404 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RSU1Q15404 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RSU1Q15404 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RSU1Q15404 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RSU1Q15404 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RSU1Q15404 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RSU1Q15404 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RSU1Q15404 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RSU1Q15404 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RSU1Q15404 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RSU1Q15404 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RSU1Q15404 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RSU1Q15404 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RSU1Q15404 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RSU1Q15404 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RSU1Q15404 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RSU1Q15404 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RSU1Q15404 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RSU1Q15404 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RSU1Q15404 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RSU1Q15404 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RSU1Q15404 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RSU1Q15404 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RSU1Q15404 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RSU1Q15404 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RSU1Q15404 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RSU1Q15404 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RSU1Q15404 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RSU1Q15404 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RSU1Q15404 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RSU1Q15404 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RSU1Q15404 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RSU1Q15404 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RSU1Q15404 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RSU1Q15404 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RSU1Q15404 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RSU1Q15404 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RSU1Q15404 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RSU1Q15404 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RSU1Q15404 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RSU1Q15404 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RSU1Q15404 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RSU1Q15404 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RSU1Q15404 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RSU1Q15404 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RSU1Q15404 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RSU1Q15404 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RSU1Q15404 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RSU1Q15404 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RSU1Q15404 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RSU1Q15404 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RSU1Q15404 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RSU1Q15404 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RSU1Q15404 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RSU1Q15404 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RSU1Q15404 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RSU1Q15404 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RSU1Q15404 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RSU1Q15404 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RSU1Q15404 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RSU1Q15404 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RSU1Q15404 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RSU1Q15404 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RSU1Q15404 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RSU1Q15404 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RSU1Q15404 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RSU1Q15404 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RSU1Q15404 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RSU1Q15404 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RSU1Q15404 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RSU1Q15404 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RSU1Q15404 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RSU1Q15404 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RSU1Q15404 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RSU1Q15404 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RSU1Q15404 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RSU1Q15404 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RSU1Q15404 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RSU1Q15404 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RSU1Q15404 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RSU1Q15404 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RSU1Q15404 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RSU1Q15404 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RSU1Q15404 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 280.3 ms