Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCM1Q15154 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCM1Q15154 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCM1Q15154 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCM1Q15154 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCM1Q15154 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCM1Q15154 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCM1Q15154 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCM1Q15154 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCM1Q15154 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PCM1Q15154 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCM1Q15154 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCM1Q15154 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCM1Q15154 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCM1Q15154 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCM1Q15154 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCM1Q15154 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCM1Q15154 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCM1Q15154 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCM1Q15154 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCM1Q15154 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCM1Q15154 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PCM1Q15154 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCM1Q15154 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCM1Q15154 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCM1Q15154 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCM1Q15154 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCM1Q15154 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCM1Q15154 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCM1Q15154 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCM1Q15154 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PCM1Q15154 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCM1Q15154 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCM1Q15154 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCM1Q15154 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCM1Q15154 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCM1Q15154 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCM1Q15154 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCM1Q15154 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCM1Q15154 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCM1Q15154 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCM1Q15154 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCM1Q15154 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCM1Q15154 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCM1Q15154 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCM1Q15154 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCM1Q15154 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCM1Q15154 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCM1Q15154 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCM1Q15154 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCM1Q15154 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCM1Q15154 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCM1Q15154 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCM1Q15154 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCM1Q15154 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCM1Q15154 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCM1Q15154 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCM1Q15154 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCM1Q15154 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCM1Q15154 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCM1Q15154 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCM1Q15154 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCM1Q15154 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCM1Q15154 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCM1Q15154 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCM1Q15154 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PCM1Q15154 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCM1Q15154 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCM1Q15154 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCM1Q15154 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PCM1Q15154 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCM1Q15154 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCM1Q15154 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCM1Q15154 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCM1Q15154 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCM1Q15154 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCM1Q15154 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCM1Q15154 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCM1Q15154 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCM1Q15154 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCM1Q15154 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCM1Q15154 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCM1Q15154 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCM1Q15154 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCM1Q15154 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCM1Q15154 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PCM1Q15154 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCM1Q15154 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCM1Q15154 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCM1Q15154 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCM1Q15154 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCM1Q15154 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCM1Q15154 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCM1Q15154 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCM1Q15154 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCM1Q15154 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCM1Q15154 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCM1Q15154 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCM1Q15154 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCM1Q15154 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
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