Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCOLCEQ15113 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCOLCEQ15113 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PCOLCEQ15113 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCOLCEQ15113 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCOLCEQ15113 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCOLCEQ15113 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCOLCEQ15113 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCOLCEQ15113 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCOLCEQ15113 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCOLCEQ15113 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCOLCEQ15113 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCOLCEQ15113 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCOLCEQ15113 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCOLCEQ15113 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PCOLCEQ15113 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCOLCEQ15113 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCOLCEQ15113 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCOLCEQ15113 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCOLCEQ15113 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCOLCEQ15113 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCOLCEQ15113 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCOLCEQ15113 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCOLCEQ15113 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCOLCEQ15113 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCOLCEQ15113 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCOLCEQ15113 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCOLCEQ15113 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCOLCEQ15113 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCOLCEQ15113 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCOLCEQ15113 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCOLCEQ15113 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCOLCEQ15113 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCOLCEQ15113 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCOLCEQ15113 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCOLCEQ15113 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PCOLCEQ15113 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCOLCEQ15113 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PCOLCEQ15113 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCOLCEQ15113 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCOLCEQ15113 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCOLCEQ15113 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCOLCEQ15113 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCOLCEQ15113 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCOLCEQ15113 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCOLCEQ15113 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCOLCEQ15113 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCOLCEQ15113 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCOLCEQ15113 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCOLCEQ15113 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCOLCEQ15113 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCOLCEQ15113 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCOLCEQ15113 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCOLCEQ15113 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCOLCEQ15113 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PCOLCEQ15113 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCOLCEQ15113 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCOLCEQ15113 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCOLCEQ15113 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCOLCEQ15113 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCOLCEQ15113 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCOLCEQ15113 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCOLCEQ15113 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCOLCEQ15113 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCOLCEQ15113 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCOLCEQ15113 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCOLCEQ15113 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCOLCEQ15113 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCOLCEQ15113 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCOLCEQ15113 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCOLCEQ15113 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCOLCEQ15113 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCOLCEQ15113 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCOLCEQ15113 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PCOLCEQ15113 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PCOLCEQ15113 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCOLCEQ15113 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCOLCEQ15113 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCOLCEQ15113 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCOLCEQ15113 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCOLCEQ15113 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PCOLCEQ15113 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCOLCEQ15113 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCOLCEQ15113 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCOLCEQ15113 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCOLCEQ15113 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCOLCEQ15113 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCOLCEQ15113 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCOLCEQ15113 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCOLCEQ15113 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCOLCEQ15113 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCOLCEQ15113 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCOLCEQ15113 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCOLCEQ15113 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCOLCEQ15113 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCOLCEQ15113 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCOLCEQ15113 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCOLCEQ15113 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PCOLCEQ15113 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCOLCEQ15113 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
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