Protein–RNA interactions for Protein: Q15078

CDK5R1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, humanhuman

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R1Q15078 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK5R1Q15078 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK5R1Q15078 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK5R1Q15078 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK5R1Q15078 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK5R1Q15078 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK5R1Q15078 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK5R1Q15078 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK5R1Q15078 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK5R1Q15078 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK5R1Q15078 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK5R1Q15078 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK5R1Q15078 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK5R1Q15078 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK5R1Q15078 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDK5R1Q15078 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDK5R1Q15078 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK5R1Q15078 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK5R1Q15078 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK5R1Q15078 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK5R1Q15078 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK5R1Q15078 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK5R1Q15078 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK5R1Q15078 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK5R1Q15078 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK5R1Q15078 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK5R1Q15078 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK5R1Q15078 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK5R1Q15078 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK5R1Q15078 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK5R1Q15078 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK5R1Q15078 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK5R1Q15078 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK5R1Q15078 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK5R1Q15078 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK5R1Q15078 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK5R1Q15078 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK5R1Q15078 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK5R1Q15078 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK5R1Q15078 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK5R1Q15078 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK5R1Q15078 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK5R1Q15078 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK5R1Q15078 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK5R1Q15078 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK5R1Q15078 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK5R1Q15078 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK5R1Q15078 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK5R1Q15078 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK5R1Q15078 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK5R1Q15078 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDK5R1Q15078 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK5R1Q15078 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK5R1Q15078 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK5R1Q15078 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK5R1Q15078 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK5R1Q15078 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK5R1Q15078 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK5R1Q15078 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK5R1Q15078 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK5R1Q15078 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK5R1Q15078 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK5R1Q15078 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK5R1Q15078 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK5R1Q15078 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK5R1Q15078 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK5R1Q15078 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK5R1Q15078 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK5R1Q15078 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK5R1Q15078 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK5R1Q15078 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK5R1Q15078 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK5R1Q15078 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK5R1Q15078 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK5R1Q15078 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK5R1Q15078 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CDK5R1Q15078 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK5R1Q15078 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK5R1Q15078 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK5R1Q15078 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK5R1Q15078 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK5R1Q15078 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK5R1Q15078 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK5R1Q15078 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK5R1Q15078 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK5R1Q15078 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK5R1Q15078 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK5R1Q15078 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK5R1Q15078 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK5R1Q15078 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK5R1Q15078 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK5R1Q15078 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK5R1Q15078 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK5R1Q15078 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK5R1Q15078 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK5R1Q15078 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK5R1Q15078 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK5R1Q15078 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK5R1Q15078 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK5R1Q15078 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
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