Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BRD3Q15059 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BRD3Q15059 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BRD3Q15059 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BRD3Q15059 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BRD3Q15059 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BRD3Q15059 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BRD3Q15059 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BRD3Q15059 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BRD3Q15059 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BRD3Q15059 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
BRD3Q15059 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BRD3Q15059 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRD3Q15059 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRD3Q15059 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRD3Q15059 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRD3Q15059 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRD3Q15059 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRD3Q15059 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRD3Q15059 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
BRD3Q15059 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
BRD3Q15059 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BRD3Q15059 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
BRD3Q15059 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BRD3Q15059 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRD3Q15059 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRD3Q15059 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRD3Q15059 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRD3Q15059 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
BRD3Q15059 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRD3Q15059 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRD3Q15059 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRD3Q15059 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRD3Q15059 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRD3Q15059 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRD3Q15059 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRD3Q15059 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRD3Q15059 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRD3Q15059 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRD3Q15059 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRD3Q15059 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRD3Q15059 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRD3Q15059 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRD3Q15059 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRD3Q15059 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRD3Q15059 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRD3Q15059 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRD3Q15059 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRD3Q15059 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRD3Q15059 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRD3Q15059 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRD3Q15059 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRD3Q15059 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
BRD3Q15059 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRD3Q15059 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
BRD3Q15059 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRD3Q15059 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRD3Q15059 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRD3Q15059 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRD3Q15059 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRD3Q15059 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRD3Q15059 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRD3Q15059 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRD3Q15059 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRD3Q15059 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRD3Q15059 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRD3Q15059 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRD3Q15059 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRD3Q15059 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRD3Q15059 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRD3Q15059 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRD3Q15059 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRD3Q15059 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
BRD3Q15059 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
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BRD3Q15059 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRD3Q15059 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
BRD3Q15059 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRD3Q15059 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRD3Q15059 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRD3Q15059 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRD3Q15059 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRD3Q15059 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRD3Q15059 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRD3Q15059 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRD3Q15059 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRD3Q15059 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRD3Q15059 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRD3Q15059 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRD3Q15059 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRD3Q15059 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRD3Q15059 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRD3Q15059 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRD3Q15059 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRD3Q15059 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRD3Q15059 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRD3Q15059 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRD3Q15059 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRD3Q15059 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRD3Q15059 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
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