Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL19A1Q14993 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL19A1Q14993 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL19A1Q14993 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL19A1Q14993 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
COL19A1Q14993 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL19A1Q14993 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL19A1Q14993 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
COL19A1Q14993 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
COL19A1Q14993 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
COL19A1Q14993 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
COL19A1Q14993 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
COL19A1Q14993 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COL19A1Q14993 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL19A1Q14993 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL19A1Q14993 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL19A1Q14993 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COL19A1Q14993 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
COL19A1Q14993 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
COL19A1Q14993 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COL19A1Q14993 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL19A1Q14993 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL19A1Q14993 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
COL19A1Q14993 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL19A1Q14993 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL19A1Q14993 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
COL19A1Q14993 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
COL19A1Q14993 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL19A1Q14993 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL19A1Q14993 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
COL19A1Q14993 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COL19A1Q14993 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COL19A1Q14993 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
COL19A1Q14993 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL19A1Q14993 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL19A1Q14993 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
COL19A1Q14993 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL19A1Q14993 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL19A1Q14993 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL19A1Q14993 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL19A1Q14993 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL19A1Q14993 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL19A1Q14993 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
COL19A1Q14993 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL19A1Q14993 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL19A1Q14993 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
COL19A1Q14993 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL19A1Q14993 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL19A1Q14993 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL19A1Q14993 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL19A1Q14993 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL19A1Q14993 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL19A1Q14993 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL19A1Q14993 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL19A1Q14993 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL19A1Q14993 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL19A1Q14993 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COL19A1Q14993 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
COL19A1Q14993 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
COL19A1Q14993 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
COL19A1Q14993 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COL19A1Q14993 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
COL19A1Q14993 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COL19A1Q14993 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COL19A1Q14993 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COL19A1Q14993 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
COL19A1Q14993 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
COL19A1Q14993 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
COL19A1Q14993 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
COL19A1Q14993 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
COL19A1Q14993 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
COL19A1Q14993 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
COL19A1Q14993 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
COL19A1Q14993 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
COL19A1Q14993 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
COL19A1Q14993 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
COL19A1Q14993 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
COL19A1Q14993 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
COL19A1Q14993 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
COL19A1Q14993 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
COL19A1Q14993 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
COL19A1Q14993 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
COL19A1Q14993 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
COL19A1Q14993 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
COL19A1Q14993 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
COL19A1Q14993 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
COL19A1Q14993 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
COL19A1Q14993 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COL19A1Q14993 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COL19A1Q14993 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
COL19A1Q14993 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
COL19A1Q14993 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COL19A1Q14993 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COL19A1Q14993 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
COL19A1Q14993 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
COL19A1Q14993 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
COL19A1Q14993 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
COL19A1Q14993 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
COL19A1Q14993 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
COL19A1Q14993 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
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