Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SEMA3AQ14563 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA3AQ14563 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA3AQ14563 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA3AQ14563 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA3AQ14563 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA3AQ14563 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA3AQ14563 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA3AQ14563 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA3AQ14563 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA3AQ14563 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA3AQ14563 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA3AQ14563 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA3AQ14563 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA3AQ14563 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA3AQ14563 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA3AQ14563 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA3AQ14563 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA3AQ14563 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA3AQ14563 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA3AQ14563 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA3AQ14563 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA3AQ14563 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA3AQ14563 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA3AQ14563 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA3AQ14563 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA3AQ14563 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA3AQ14563 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA3AQ14563 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA3AQ14563 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA3AQ14563 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA3AQ14563 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA3AQ14563 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SEMA3AQ14563 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SEMA3AQ14563 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA3AQ14563 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA3AQ14563 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA3AQ14563 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA3AQ14563 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA3AQ14563 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA3AQ14563 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA3AQ14563 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA3AQ14563 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA3AQ14563 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA3AQ14563 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA3AQ14563 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA3AQ14563 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA3AQ14563 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA3AQ14563 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA3AQ14563 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA3AQ14563 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA3AQ14563 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA3AQ14563 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA3AQ14563 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA3AQ14563 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA3AQ14563 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA3AQ14563 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA3AQ14563 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA3AQ14563 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA3AQ14563 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA3AQ14563 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA3AQ14563 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA3AQ14563 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA3AQ14563 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA3AQ14563 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA3AQ14563 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA3AQ14563 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA3AQ14563 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA3AQ14563 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA3AQ14563 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA3AQ14563 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA3AQ14563 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA3AQ14563 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA3AQ14563 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA3AQ14563 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA3AQ14563 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA3AQ14563 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA3AQ14563 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA3AQ14563 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA3AQ14563 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA3AQ14563 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA3AQ14563 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA3AQ14563 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA3AQ14563 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA3AQ14563 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEMA3AQ14563 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEMA3AQ14563 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEMA3AQ14563 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEMA3AQ14563 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEMA3AQ14563 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SEMA3AQ14563 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SEMA3AQ14563 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEMA3AQ14563 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEMA3AQ14563 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEMA3AQ14563 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA3AQ14563 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA3AQ14563 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA3AQ14563 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA3AQ14563 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA3AQ14563 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
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