Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CNGB1Q14028 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CNGB1Q14028 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CNGB1Q14028 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CNGB1Q14028 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CNGB1Q14028 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
CNGB1Q14028 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CNGB1Q14028 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CNGB1Q14028 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CNGB1Q14028 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CNGB1Q14028 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CNGB1Q14028 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CNGB1Q14028 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CNGB1Q14028 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CNGB1Q14028 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CNGB1Q14028 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CNGB1Q14028 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CNGB1Q14028 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CNGB1Q14028 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CNGB1Q14028 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CNGB1Q14028 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CNGB1Q14028 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CNGB1Q14028 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
CNGB1Q14028 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CNGB1Q14028 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CNGB1Q14028 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CNGB1Q14028 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CNGB1Q14028 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CNGB1Q14028 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CNGB1Q14028 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CNGB1Q14028 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CNGB1Q14028 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CNGB1Q14028 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
CNGB1Q14028 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CNGB1Q14028 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CNGB1Q14028 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CNGB1Q14028 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CNGB1Q14028 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CNGB1Q14028 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CNGB1Q14028 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CNGB1Q14028 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CNGB1Q14028 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CNGB1Q14028 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CNGB1Q14028 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CNGB1Q14028 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
CNGB1Q14028 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CNGB1Q14028 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CNGB1Q14028 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CNGB1Q14028 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CNGB1Q14028 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CNGB1Q14028 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CNGB1Q14028 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CNGB1Q14028 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CNGB1Q14028 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CNGB1Q14028 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CNGB1Q14028 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CNGB1Q14028 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CNGB1Q14028 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CNGB1Q14028 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CNGB1Q14028 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CNGB1Q14028 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CNGB1Q14028 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CNGB1Q14028 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
CNGB1Q14028 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CNGB1Q14028 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CNGB1Q14028 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CNGB1Q14028 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CNGB1Q14028 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CNGB1Q14028 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CNGB1Q14028 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CNGB1Q14028 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CNGB1Q14028 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CNGB1Q14028 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CNGB1Q14028 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CNGB1Q14028 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CNGB1Q14028 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CNGB1Q14028 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CNGB1Q14028 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CNGB1Q14028 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CNGB1Q14028 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CNGB1Q14028 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CNGB1Q14028 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CNGB1Q14028 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CNGB1Q14028 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CNGB1Q14028 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CNGB1Q14028 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CNGB1Q14028 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CNGB1Q14028 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CNGB1Q14028 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CNGB1Q14028 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CNGB1Q14028 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CNGB1Q14028 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CNGB1Q14028 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CNGB1Q14028 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CNGB1Q14028 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CNGB1Q14028 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CNGB1Q14028 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CNGB1Q14028 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CNGB1Q14028 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CNGB1Q14028 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
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