Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ALCAMQ13740 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ALCAMQ13740 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ALCAMQ13740 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ALCAMQ13740 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ALCAMQ13740 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ALCAMQ13740 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ALCAMQ13740 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ALCAMQ13740 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ALCAMQ13740 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ALCAMQ13740 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ALCAMQ13740 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ALCAMQ13740 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ALCAMQ13740 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ALCAMQ13740 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ALCAMQ13740 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ALCAMQ13740 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ALCAMQ13740 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ALCAMQ13740 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ALCAMQ13740 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ALCAMQ13740 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ALCAMQ13740 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ALCAMQ13740 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ALCAMQ13740 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ALCAMQ13740 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ALCAMQ13740 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ALCAMQ13740 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ALCAMQ13740 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ALCAMQ13740 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ALCAMQ13740 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ALCAMQ13740 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ALCAMQ13740 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ALCAMQ13740 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ALCAMQ13740 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ALCAMQ13740 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ALCAMQ13740 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ALCAMQ13740 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ALCAMQ13740 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ALCAMQ13740 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ALCAMQ13740 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ALCAMQ13740 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ALCAMQ13740 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ALCAMQ13740 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ALCAMQ13740 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ALCAMQ13740 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ALCAMQ13740 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ALCAMQ13740 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ALCAMQ13740 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ALCAMQ13740 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ALCAMQ13740 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ALCAMQ13740 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ALCAMQ13740 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ALCAMQ13740 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ALCAMQ13740 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ALCAMQ13740 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ALCAMQ13740 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ALCAMQ13740 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ALCAMQ13740 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ALCAMQ13740 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ALCAMQ13740 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ALCAMQ13740 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ALCAMQ13740 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ALCAMQ13740 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ALCAMQ13740 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ALCAMQ13740 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ALCAMQ13740 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ALCAMQ13740 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ALCAMQ13740 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ALCAMQ13740 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ALCAMQ13740 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ALCAMQ13740 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ALCAMQ13740 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ALCAMQ13740 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ALCAMQ13740 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ALCAMQ13740 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ALCAMQ13740 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALCAMQ13740 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALCAMQ13740 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALCAMQ13740 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALCAMQ13740 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALCAMQ13740 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALCAMQ13740 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALCAMQ13740 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALCAMQ13740 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALCAMQ13740 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ALCAMQ13740 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ALCAMQ13740 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ALCAMQ13740 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ALCAMQ13740 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ALCAMQ13740 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ALCAMQ13740 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ALCAMQ13740 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ALCAMQ13740 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ALCAMQ13740 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ALCAMQ13740 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ALCAMQ13740 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ALCAMQ13740 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ALCAMQ13740 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ALCAMQ13740 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ALCAMQ13740 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms