Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBE2V1Q13404 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBE2V1Q13404 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBE2V1Q13404 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBE2V1Q13404 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBE2V1Q13404 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBE2V1Q13404 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBE2V1Q13404 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBE2V1Q13404 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBE2V1Q13404 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBE2V1Q13404 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBE2V1Q13404 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBE2V1Q13404 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBE2V1Q13404 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBE2V1Q13404 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBE2V1Q13404 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBE2V1Q13404 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBE2V1Q13404 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBE2V1Q13404 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBE2V1Q13404 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBE2V1Q13404 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBE2V1Q13404 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBE2V1Q13404 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE2V1Q13404 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE2V1Q13404 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UBE2V1Q13404 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
UBE2V1Q13404 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
UBE2V1Q13404 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
UBE2V1Q13404 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE2V1Q13404 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE2V1Q13404 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE2V1Q13404 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE2V1Q13404 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE2V1Q13404 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UBE2V1Q13404 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE2V1Q13404 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE2V1Q13404 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE2V1Q13404 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE2V1Q13404 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBE2V1Q13404 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE2V1Q13404 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE2V1Q13404 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE2V1Q13404 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE2V1Q13404 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE2V1Q13404 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBE2V1Q13404 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE2V1Q13404 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE2V1Q13404 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE2V1Q13404 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE2V1Q13404 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE2V1Q13404 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE2V1Q13404 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
UBE2V1Q13404 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE2V1Q13404 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE2V1Q13404 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE2V1Q13404 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE2V1Q13404 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE2V1Q13404 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE2V1Q13404 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE2V1Q13404 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBE2V1Q13404 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE2V1Q13404 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE2V1Q13404 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE2V1Q13404 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE2V1Q13404 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE2V1Q13404 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
UBE2V1Q13404 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2V1Q13404 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2V1Q13404 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2V1Q13404 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2V1Q13404 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2V1Q13404 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2V1Q13404 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2V1Q13404 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2V1Q13404 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2V1Q13404 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2V1Q13404 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2V1Q13404 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2V1Q13404 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2V1Q13404 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2V1Q13404 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2V1Q13404 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2V1Q13404 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2V1Q13404 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2V1Q13404 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2V1Q13404 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2V1Q13404 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2V1Q13404 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2V1Q13404 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2V1Q13404 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2V1Q13404 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2V1Q13404 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2V1Q13404 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2V1Q13404 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2V1Q13404 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2V1Q13404 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2V1Q13404 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2V1Q13404 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE2V1Q13404 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UBE2V1Q13404 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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