Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERCC8Q13216 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERCC8Q13216 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ERCC8Q13216 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ERCC8Q13216 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERCC8Q13216 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERCC8Q13216 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERCC8Q13216 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERCC8Q13216 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERCC8Q13216 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERCC8Q13216 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ERCC8Q13216 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERCC8Q13216 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERCC8Q13216 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERCC8Q13216 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERCC8Q13216 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERCC8Q13216 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERCC8Q13216 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERCC8Q13216 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERCC8Q13216 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERCC8Q13216 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERCC8Q13216 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERCC8Q13216 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERCC8Q13216 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERCC8Q13216 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERCC8Q13216 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERCC8Q13216 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERCC8Q13216 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERCC8Q13216 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERCC8Q13216 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERCC8Q13216 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERCC8Q13216 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERCC8Q13216 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERCC8Q13216 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERCC8Q13216 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERCC8Q13216 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERCC8Q13216 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERCC8Q13216 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
ERCC8Q13216 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ERCC8Q13216 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ERCC8Q13216 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERCC8Q13216 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERCC8Q13216 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERCC8Q13216 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERCC8Q13216 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ERCC8Q13216 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERCC8Q13216 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ERCC8Q13216 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERCC8Q13216 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERCC8Q13216 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERCC8Q13216 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERCC8Q13216 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERCC8Q13216 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERCC8Q13216 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERCC8Q13216 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERCC8Q13216 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERCC8Q13216 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERCC8Q13216 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERCC8Q13216 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERCC8Q13216 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERCC8Q13216 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ERCC8Q13216 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERCC8Q13216 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERCC8Q13216 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERCC8Q13216 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERCC8Q13216 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ERCC8Q13216 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERCC8Q13216 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERCC8Q13216 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERCC8Q13216 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERCC8Q13216 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERCC8Q13216 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERCC8Q13216 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERCC8Q13216 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERCC8Q13216 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERCC8Q13216 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERCC8Q13216 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERCC8Q13216 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERCC8Q13216 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERCC8Q13216 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERCC8Q13216 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERCC8Q13216 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERCC8Q13216 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERCC8Q13216 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERCC8Q13216 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERCC8Q13216 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERCC8Q13216 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERCC8Q13216 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERCC8Q13216 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERCC8Q13216 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERCC8Q13216 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERCC8Q13216 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERCC8Q13216 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERCC8Q13216 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERCC8Q13216 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERCC8Q13216 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERCC8Q13216 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ERCC8Q13216 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERCC8Q13216 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERCC8Q13216 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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