Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NFIAQ12857 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NFIAQ12857 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NFIAQ12857 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NFIAQ12857 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NFIAQ12857 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NFIAQ12857 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NFIAQ12857 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NFIAQ12857 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NFIAQ12857 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NFIAQ12857 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NFIAQ12857 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NFIAQ12857 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
NFIAQ12857 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NFIAQ12857 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NFIAQ12857 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NFIAQ12857 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NFIAQ12857 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NFIAQ12857 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NFIAQ12857 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NFIAQ12857 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NFIAQ12857 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NFIAQ12857 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
NFIAQ12857 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NFIAQ12857 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NFIAQ12857 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NFIAQ12857 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NFIAQ12857 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
NFIAQ12857 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NFIAQ12857 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
NFIAQ12857 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NFIAQ12857 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NFIAQ12857 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
NFIAQ12857 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NFIAQ12857 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NFIAQ12857 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NFIAQ12857 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NFIAQ12857 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
NFIAQ12857 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NFIAQ12857 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NFIAQ12857 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NFIAQ12857 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NFIAQ12857 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NFIAQ12857 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
NFIAQ12857 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NFIAQ12857 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NFIAQ12857 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NFIAQ12857 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NFIAQ12857 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NFIAQ12857 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NFIAQ12857 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NFIAQ12857 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NFIAQ12857 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NFIAQ12857 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NFIAQ12857 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
NFIAQ12857 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NFIAQ12857 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NFIAQ12857 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NFIAQ12857 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NFIAQ12857 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NFIAQ12857 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NFIAQ12857 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NFIAQ12857 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NFIAQ12857 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NFIAQ12857 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NFIAQ12857 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NFIAQ12857 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
NFIAQ12857 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NFIAQ12857 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NFIAQ12857 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NFIAQ12857 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
NFIAQ12857 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NFIAQ12857 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NFIAQ12857 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NFIAQ12857 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NFIAQ12857 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NFIAQ12857 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NFIAQ12857 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NFIAQ12857 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NFIAQ12857 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
NFIAQ12857 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NFIAQ12857 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NFIAQ12857 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NFIAQ12857 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NFIAQ12857 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NFIAQ12857 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NFIAQ12857 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NFIAQ12857 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NFIAQ12857 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NFIAQ12857 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NFIAQ12857 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NFIAQ12857 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NFIAQ12857 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NFIAQ12857 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
NFIAQ12857 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
NFIAQ12857 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NFIAQ12857 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NFIAQ12857 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
NFIAQ12857 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NFIAQ12857 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
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