Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDE4CQ08493 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PDE4CQ08493 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDE4CQ08493 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDE4CQ08493 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDE4CQ08493 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDE4CQ08493 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDE4CQ08493 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDE4CQ08493 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDE4CQ08493 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDE4CQ08493 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDE4CQ08493 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE4CQ08493 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE4CQ08493 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE4CQ08493 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE4CQ08493 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE4CQ08493 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE4CQ08493 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE4CQ08493 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE4CQ08493 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE4CQ08493 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE4CQ08493 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE4CQ08493 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE4CQ08493 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE4CQ08493 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE4CQ08493 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDE4CQ08493 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDE4CQ08493 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE4CQ08493 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE4CQ08493 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE4CQ08493 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE4CQ08493 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE4CQ08493 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE4CQ08493 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDE4CQ08493 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PDE4CQ08493 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDE4CQ08493 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PDE4CQ08493 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE4CQ08493 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE4CQ08493 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE4CQ08493 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE4CQ08493 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE4CQ08493 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE4CQ08493 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE4CQ08493 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE4CQ08493 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE4CQ08493 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE4CQ08493 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE4CQ08493 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE4CQ08493 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE4CQ08493 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE4CQ08493 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE4CQ08493 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE4CQ08493 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE4CQ08493 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE4CQ08493 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE4CQ08493 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE4CQ08493 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE4CQ08493 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE4CQ08493 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE4CQ08493 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE4CQ08493 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE4CQ08493 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE4CQ08493 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE4CQ08493 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE4CQ08493 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE4CQ08493 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE4CQ08493 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE4CQ08493 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE4CQ08493 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE4CQ08493 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE4CQ08493 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE4CQ08493 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE4CQ08493 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE4CQ08493 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE4CQ08493 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE4CQ08493 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE4CQ08493 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE4CQ08493 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE4CQ08493 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE4CQ08493 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDE4CQ08493 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDE4CQ08493 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDE4CQ08493 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDE4CQ08493 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDE4CQ08493 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDE4CQ08493 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDE4CQ08493 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDE4CQ08493 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDE4CQ08493 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDE4CQ08493 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDE4CQ08493 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDE4CQ08493 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDE4CQ08493 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDE4CQ08493 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE4CQ08493 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE4CQ08493 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE4CQ08493 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE4CQ08493 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE4CQ08493 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms