Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNG1Q06432 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNG1Q06432 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNG1Q06432 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNG1Q06432 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNG1Q06432 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACNG1Q06432 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACNG1Q06432 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACNG1Q06432 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACNG1Q06432 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACNG1Q06432 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACNG1Q06432 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACNG1Q06432 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNG1Q06432 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNG1Q06432 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNG1Q06432 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNG1Q06432 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNG1Q06432 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNG1Q06432 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNG1Q06432 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNG1Q06432 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNG1Q06432 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNG1Q06432 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNG1Q06432 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNG1Q06432 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNG1Q06432 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNG1Q06432 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNG1Q06432 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNG1Q06432 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNG1Q06432 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNG1Q06432 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNG1Q06432 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNG1Q06432 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNG1Q06432 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNG1Q06432 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNG1Q06432 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNG1Q06432 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNG1Q06432 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNG1Q06432 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNG1Q06432 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNG1Q06432 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNG1Q06432 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNG1Q06432 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNG1Q06432 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNG1Q06432 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNG1Q06432 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNG1Q06432 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNG1Q06432 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNG1Q06432 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNG1Q06432 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNG1Q06432 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNG1Q06432 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNG1Q06432 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNG1Q06432 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNG1Q06432 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNG1Q06432 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNG1Q06432 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNG1Q06432 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNG1Q06432 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNG1Q06432 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNG1Q06432 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNG1Q06432 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNG1Q06432 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNG1Q06432 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNG1Q06432 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNG1Q06432 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNG1Q06432 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNG1Q06432 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNG1Q06432 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNG1Q06432 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNG1Q06432 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNG1Q06432 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNG1Q06432 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNG1Q06432 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNG1Q06432 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNG1Q06432 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNG1Q06432 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNG1Q06432 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNG1Q06432 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNG1Q06432 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CACNG1Q06432 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CACNG1Q06432 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CACNG1Q06432 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNG1Q06432 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNG1Q06432 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNG1Q06432 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNG1Q06432 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNG1Q06432 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNG1Q06432 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNG1Q06432 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNG1Q06432 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNG1Q06432 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNG1Q06432 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNG1Q06432 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNG1Q06432 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNG1Q06432 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNG1Q06432 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNG1Q06432 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNG1Q06432 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNG1Q06432 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms