Protein–RNA interactions for Protein: Q05919

VPS38, Vacuolar protein sorting-associated protein 38, yeastyeast

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS38Q05919 MTR3YGR158C 753 nt7.68□□□□□ -1.18
VPS38Q05919 KIN1YDR122W 3195 nt7.68□□□□□ -1.18
VPS38Q05919 IRC5YFR038W 2562 nt7.67□□□□□ -1.18
VPS38Q05919 EFM1YHL039W 1758 nt7.67□□□□□ -1.18
VPS38Q05919 THR1YHR025W 1074 nt7.67□□□□□ -1.18
VPS38Q05919 CIT2YCR005C 1383 nt7.67□□□□□ -1.18
VPS38Q05919 MCH2YKL221W 1422 nt7.67□□□□□ -1.18
VPS38Q05919 CTA1YDR256C 1548 nt7.67□□□□□ -1.18
VPS38Q05919 AMN1YBR158W 1650 nt7.67□□□□□ -1.18
VPS38Q05919 MAM3YOL060C 2121 nt7.66□□□□□ -1.18
VPS38Q05919 ARC35YNR035C 1029 nt7.66□□□□□ -1.18
VPS38Q05919 CEM1YER061C 1329 nt7.65□□□□□ -1.18
VPS38Q05919 DOC1YGL240W 753 nt7.65□□□□□ -1.18
VPS38Q05919 PAM17YKR065C 594 nt7.65□□□□□ -1.18
VPS38Q05919 MIX17YMR002W 471 nt7.65□□□□□ -1.18
VPS38Q05919 RIB1YBL033C 1038 nt7.65□□□□□ -1.18
VPS38Q05919 FCP1YMR277W 2199 nt7.65□□□□□ -1.18
VPS38Q05919 PAU21YOR394W 495 nt7.65□□□□□ -1.18
VPS38Q05919 PAU22YPL282C 495 nt7.65□□□□□ -1.18
VPS38Q05919 DPM1YPR183W 804 nt7.65□□□□□ -1.18
VPS38Q05919 DLD1YDL174C 1764 nt7.64□□□□□ -1.19
VPS38Q05919 CYB2YML054C 1776 nt7.64□□□□□ -1.19
VPS38Q05919 ERS1YCR075C 783 nt7.63□□□□□ -1.19
VPS38Q05919 FUS3YBL016W 1062 nt7.63□□□□□ -1.19
VPS38Q05919 YML122CYML122C 381 nt7.63□□□□□ -1.19
VPS38Q05919 HXT13YEL069C 1695 nt7.63□□□□□ -1.19
VPS38Q05919 HPT1YDR399W 666 nt7.62□□□□□ -1.19
VPS38Q05919 NTG1YAL015C 1200 nt7.62□□□□□ -1.19
VPS38Q05919 ADH6YMR318C 1083 nt7.62□□□□□ -1.19
VPS38Q05919 MSG5YNL053W 1470 nt7.62□□□□□ -1.19
VPS38Q05919 YCR049CYCR049C 447 nt7.61□□□□□ -1.19
VPS38Q05919 MRPL28YDR462W 444 nt7.61□□□□□ -1.19
VPS38Q05919 RQC1YDR333C 2172 nt7.6□□□□□ -1.19
VPS38Q05919 RTC4YNL254C 1206 nt7.6□□□□□ -1.19
VPS38Q05919 PET494YNR045W 1470 nt7.59□□□□□ -1.19
VPS38Q05919 YOR389WYOR389W 1875 nt7.59□□□□□ -1.19
VPS38Q05919 YBR241CYBR241C 1467 nt7.58□□□□□ -1.2
VPS38Q05919 GSH1YJL101C 2037 nt7.58□□□□□ -1.2
VPS38Q05919 TAH11YJR046W 1815 nt7.58□□□□□ -1.2
VPS38Q05919 GPH1YPR160W 2709 nt7.58□□□□□ -1.2
VPS38Q05919 CCT3YJL014W 1605 nt7.58□□□□□ -1.2
VPS38Q05919 HBN1YCL026C-B 582 nt7.57□□□□□ -1.2
VPS38Q05919 YEL023CYEL023C 2049 nt7.57□□□□□ -1.2
VPS38Q05919 NFS1YCL017C 1494 nt7.56□□□□□ -1.2
VPS38Q05919 RPL2BYIL018W 765 nt7.56□□□□□ -1.2
VPS38Q05919 YLR358CYLR358C 564 nt7.56□□□□□ -1.2
VPS38Q05919 ECM10YEL030W 1935 nt7.55□□□□□ -1.2
VPS38Q05919 TUF1YOR187W 1314 nt7.54□□□□□ -1.2
VPS38Q05919 YAL045CYAL045C 309 nt7.54□□□□□ -1.2
VPS38Q05919 YOL099CYOL099C 492 nt7.54□□□□□ -1.2
VPS38Q05919 YPQ2YDR352W 954 nt7.53□□□□□ -1.2
VPS38Q05919 SSC1YJR045C 1965 nt7.53□□□□□ -1.2
VPS38Q05919 MPE1YKL059C 1326 nt7.52□□□□□ -1.2
VPS38Q05919 CDC13YDL220C 2775 nt7.52□□□□□ -1.21
VPS38Q05919 TRR1YDR353W 960 nt7.52□□□□□ -1.21
VPS38Q05919 RDN5-2RDN5-2 119 nt7.52□□□□□ -1.21
VPS38Q05919 RDN5-3RDN5-3 119 nt7.52□□□□□ -1.21
VPS38Q05919 RDN5-4RDN5-4 119 nt7.52□□□□□ -1.21
VPS38Q05919 RDN5-5RDN5-5 119 nt7.52□□□□□ -1.21
VPS38Q05919 YOR343CYOR343C 327 nt7.52□□□□□ -1.21
VPS38Q05919 YLL066CYLL066C 3618 nt7.52□□□□□ -1.21
VPS38Q05919 TUB1YML085C 1344 nt7.51□□□□□ -1.21
VPS38Q05919 MEU1YLR017W 1014 nt7.5□□□□□ -1.21
VPS38Q05919 YNR014WYNR014W 639 nt7.5□□□□□ -1.21
VPS38Q05919 ATP23YNR020C 813 nt7.5□□□□□ -1.21
VPS38Q05919 YJL045WYJL045W 1905 nt7.5□□□□□ -1.21
VPS38Q05919 PAC2YER007W 1557 nt7.5□□□□□ -1.21
VPS38Q05919 PLB2YMR006C 2121 nt7.49□□□□□ -1.21
VPS38Q05919 MLS1YNL117W 1665 nt7.49□□□□□ -1.21
VPS38Q05919 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt7.49□□□□□ -1.21
VPS38Q05919 RGD2YFL047W 2145 nt7.48□□□□□ -1.21
VPS38Q05919 STF1YDL130W-A 261 nt7.48□□□□□ -1.21
VPS38Q05919 COX16YJL003W 357 nt7.48□□□□□ -1.21
VPS38Q05919 RRN10YBL025W 438 nt7.48□□□□□ -1.21
VPS38Q05919 SMK1YPR054W 1167 nt7.48□□□□□ -1.21
VPS38Q05919 YPR130CYPR130C 408 nt7.48□□□□□ -1.21
VPS38Q05919 CBK1YNL161W 2271 nt7.48□□□□□ -1.21
VPS38Q05919 SLA2YNL243W 2907 nt7.48□□□□□ -1.21
VPS38Q05919 BRN1YBL097W 2265 nt7.47□□□□□ -1.21
VPS38Q05919 MSB3YNL293W 1902 nt7.46□□□□□ -1.21
VPS38Q05919 GET4YOR164C 939 nt7.46□□□□□ -1.22
VPS38Q05919 OPI11YPR044C 354 nt7.46□□□□□ -1.22
VPS38Q05919 DML1YMR211W 1428 nt7.45□□□□□ -1.22
VPS38Q05919 ADE5,7YGL234W 2409 nt7.45□□□□□ -1.22
VPS38Q05919 TRS31YDR472W 852 nt7.45□□□□□ -1.22
VPS38Q05919 PIH1YHR034C 1035 nt7.45□□□□□ -1.22
VPS38Q05919 KAE1YKR038C 1161 nt7.45□□□□□ -1.22
VPS38Q05919 YPL247CYPL247C 1572 nt7.45□□□□□ -1.22
VPS38Q05919 PPH22YDL188C 1134 nt7.44□□□□□ -1.22
VPS38Q05919 URH1YDR400W 1023 nt7.44□□□□□ -1.22
VPS38Q05919 YPL041CYPL041C 624 nt7.44□□□□□ -1.22
VPS38Q05919 YPL067CYPL067C 597 nt7.44□□□□□ -1.22
VPS38Q05919 UME1YPL139C 1383 nt7.43□□□□□ -1.22
VPS38Q05919 ICL2YPR006C 1728 nt7.42□□□□□ -1.22
VPS38Q05919 REC107YJR021C 945 nt7.42□□□□□ -1.22
VPS38Q05919 NTG2YOL043C 1143 nt7.42□□□□□ -1.22
VPS38Q05919 RPL5YPL131W 894 nt7.42□□□□□ -1.22
VPS38Q05919 PDA1YER178W 1263 nt7.41□□□□□ -1.22
VPS38Q05919 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt7.41□□□□□ -1.22
VPS38Q05919 CBR1YIL043C 855 nt7.41□□□□□ -1.22
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