Protein–RNA interactions for Protein: Q05513

PRKCZ, Protein kinase C zeta type, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZQ05513 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRKCZQ05513 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRKCZQ05513 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRKCZQ05513 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRKCZQ05513 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRKCZQ05513 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRKCZQ05513 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRKCZQ05513 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRKCZQ05513 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRKCZQ05513 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRKCZQ05513 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PRKCZQ05513 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRKCZQ05513 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRKCZQ05513 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PRKCZQ05513 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRKCZQ05513 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRKCZQ05513 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRKCZQ05513 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRKCZQ05513 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRKCZQ05513 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PRKCZQ05513 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRKCZQ05513 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRKCZQ05513 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PRKCZQ05513 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRKCZQ05513 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRKCZQ05513 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRKCZQ05513 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRKCZQ05513 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRKCZQ05513 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRKCZQ05513 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRKCZQ05513 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRKCZQ05513 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRKCZQ05513 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRKCZQ05513 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRKCZQ05513 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRKCZQ05513 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRKCZQ05513 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRKCZQ05513 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRKCZQ05513 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRKCZQ05513 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRKCZQ05513 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRKCZQ05513 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRKCZQ05513 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRKCZQ05513 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRKCZQ05513 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRKCZQ05513 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRKCZQ05513 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRKCZQ05513 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRKCZQ05513 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRKCZQ05513 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRKCZQ05513 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRKCZQ05513 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRKCZQ05513 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRKCZQ05513 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRKCZQ05513 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRKCZQ05513 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRKCZQ05513 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRKCZQ05513 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRKCZQ05513 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRKCZQ05513 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PRKCZQ05513 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRKCZQ05513 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRKCZQ05513 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms