Protein–RNA interactions for Protein: Q04712

RRN11, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN11, yeastyeast

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN11Q04712 HAM1YJR069C 594 nt6.98□□□□□ -1.29
RRN11Q04712 PRY2YKR013W 990 nt6.98□□□□□ -1.29
RRN11Q04712 CST26YBR042C 1194 nt6.98□□□□□ -1.29
RRN11Q04712 AOS1YPR180W 1044 nt6.98□□□□□ -1.29
RRN11Q04712 HGH1YGR187C 1185 nt6.97□□□□□ -1.29
RRN11Q04712 PAM17YKR065C 594 nt6.97□□□□□ -1.29
RRN11Q04712 AAD14YNL331C 1131 nt6.97□□□□□ -1.29
RRN11Q04712 SPS1YDR523C 1473 nt6.97□□□□□ -1.29
RRN11Q04712 AVL9YLR114C 2295 nt6.97□□□□□ -1.29
RRN11Q04712 PIL1YGR086C 1020 nt6.96□□□□□ -1.3
RRN11Q04712 MTC6YHR151C 1581 nt6.95□□□□□ -1.3
RRN11Q04712 DML1YMR211W 1428 nt6.95□□□□□ -1.3
RRN11Q04712 HMS2YJR147W 1077 nt6.95□□□□□ -1.3
RRN11Q04712 CDA1YLR307W 906 nt6.95□□□□□ -1.3
RRN11Q04712 ELP6YMR312W 822 nt6.95□□□□□ -1.3
RRN11Q04712 PPZ2YDR436W 2133 nt6.95□□□□□ -1.3
RRN11Q04712 EMP65YER140W 1671 nt6.94□□□□□ -1.3
RRN11Q04712 PEX28YHR150W 1740 nt6.94□□□□□ -1.3
RRN11Q04712 YML122CYML122C 381 nt6.94□□□□□ -1.3
RRN11Q04712 YPL067CYPL067C 597 nt6.94□□□□□ -1.3
RRN11Q04712 TPO1YLL028W 1761 nt6.94□□□□□ -1.3
RRN11Q04712 PDC5YLR134W 1692 nt6.93□□□□□ -1.3
RRN11Q04712 GYP8YFL027C 1494 nt6.93□□□□□ -1.3
RRN11Q04712 YPQ1YOL092W 927 nt6.93□□□□□ -1.3
RRN11Q04712 VMA2YBR127C 1554 nt6.93□□□□□ -1.3
RRN11Q04712 RUP1YOR138C 2016 nt6.93□□□□□ -1.3
RRN11Q04712 YPC1YBR183W 951 nt6.92□□□□□ -1.3
RRN11Q04712 FET4YMR319C 1659 nt6.92□□□□□ -1.3
RRN11Q04712 SKP1YDR328C 585 nt6.91□□□□□ -1.3
RRN11Q04712 YJL144WYJL144W 315 nt6.91□□□□□ -1.3
RRN11Q04712 PET10YKR046C 852 nt6.91□□□□□ -1.3
RRN11Q04712 MEU1YLR017W 1014 nt6.91□□□□□ -1.3
RRN11Q04712 YLR030WYLR030W 792 nt6.91□□□□□ -1.3
RRN11Q04712 MCP1YOR228C 909 nt6.91□□□□□ -1.3
RRN11Q04712 TUB1YML085C 1344 nt6.91□□□□□ -1.3
RRN11Q04712 UME1YPL139C 1383 nt6.91□□□□□ -1.3
RRN11Q04712 YPQ2YDR352W 954 nt6.9□□□□□ -1.3
RRN11Q04712 FRE5YOR384W 2085 nt6.89□□□□□ -1.31
RRN11Q04712 LGE1YPL055C 999 nt6.89□□□□□ -1.31
RRN11Q04712 SPE3YPR069C 882 nt6.89□□□□□ -1.31
RRN11Q04712 NOG2YNR053C 1461 nt6.89□□□□□ -1.31
RRN11Q04712 CYS3YAL012W 1185 nt6.87□□□□□ -1.31
RRN11Q04712 MET8YBR213W 825 nt6.87□□□□□ -1.31
RRN11Q04712 SLX5YDL013W 1860 nt6.87□□□□□ -1.31
RRN11Q04712 MAL31YBR298C 1845 nt6.86□□□□□ -1.31
RRN11Q04712 GNA1YFL017C 480 nt6.86□□□□□ -1.31
RRN11Q04712 YJL213WYJL213W 996 nt6.86□□□□□ -1.31
RRN11Q04712 YOR111WYOR111W 699 nt6.86□□□□□ -1.31
RRN11Q04712 PLB3YOL011W 2061 nt6.86□□□□□ -1.31
RRN11Q04712 NFS1YCL017C 1494 nt6.85□□□□□ -1.31
RRN11Q04712 NMT1YLR195C 1368 nt6.85□□□□□ -1.31
RRN11Q04712 TKL2YBR117C 2046 nt6.85□□□□□ -1.31
RRN11Q04712 DAL80YKR034W 810 nt6.85□□□□□ -1.31
RRN11Q04712 MKK1YOR231W 1527 nt6.85□□□□□ -1.31
RRN11Q04712 LEO1YOR123C 1395 nt6.84□□□□□ -1.31
RRN11Q04712 OPI1YHL020C 1215 nt6.84□□□□□ -1.31
RRN11Q04712 SNA3YJL151C 402 nt6.84□□□□□ -1.31
RRN11Q04712 MBF1YOR298C-A 456 nt6.84□□□□□ -1.31
RRN11Q04712 SKY1YMR216C 2229 nt6.83□□□□□ -1.32
RRN11Q04712 CAR2YLR438W 1275 nt6.82□□□□□ -1.32
RRN11Q04712 CLN1YMR199W 1641 nt6.82□□□□□ -1.32
RRN11Q04712 YBL113CYBL113C 2379 nt6.82□□□□□ -1.32
RRN11Q04712 CCW12YLR110C 402 nt6.81□□□□□ -1.32
RRN11Q04712 YBL070CYBL070C 321 nt6.81□□□□□ -1.32
RRN11Q04712 PUS4YNL292W 1212 nt6.81□□□□□ -1.32
RRN11Q04712 CIT2YCR005C 1383 nt6.81□□□□□ -1.32
RRN11Q04712 YKR018CYKR018C 2178 nt6.81□□□□□ -1.32
RRN11Q04712 YDR215CYDR215C 414 nt6.8□□□□□ -1.32
RRN11Q04712 SRY1YKL218C 981 nt6.8□□□□□ -1.32
RRN11Q04712 MPE1YKL059C 1326 nt6.79□□□□□ -1.32
RRN11Q04712 HXT15YDL245C 1704 nt6.79□□□□□ -1.32
RRN11Q04712 HXT16YJR158W 1704 nt6.79□□□□□ -1.32
RRN11Q04712 DCR2YLR361C 1737 nt6.79□□□□□ -1.32
RRN11Q04712 SNF7YLR025W 723 nt6.79□□□□□ -1.32
RRN11Q04712 YLR162WYLR162W 357 nt6.79□□□□□ -1.32
RRN11Q04712 ZIM17YNL310C 525 nt6.79□□□□□ -1.32
RRN11Q04712 ERG24YNL280C 1317 nt6.78□□□□□ -1.32
RRN11Q04712 GTS1YGL181W 1191 nt6.78□□□□□ -1.32
RRN11Q04712 ERV25YML012W 636 nt6.78□□□□□ -1.32
RRN11Q04712 YAH1YPL252C 519 nt6.78□□□□□ -1.32
RRN11Q04712 CDC23YHR166C 1881 nt6.78□□□□□ -1.32
RRN11Q04712 CYS4YGR155W 1524 nt6.77□□□□□ -1.33
RRN11Q04712 HXT2YMR011W 1626 nt6.77□□□□□ -1.33
RRN11Q04712 snR30snR30 606 nt6.77□□□□□ -1.33
RRN11Q04712 RTC2YBR147W 891 nt6.77□□□□□ -1.33
RRN11Q04712 TCB1YOR086C 3561 nt6.77□□□□□ -1.33
RRN11Q04712 BDS1YOL164W 1941 nt6.76□□□□□ -1.33
RRN11Q04712 TPI1YDR050C 747 nt6.76□□□□□ -1.33
RRN11Q04712 PET117YER058W 324 nt6.76□□□□□ -1.33
RRN11Q04712 VPS65YLR322W 315 nt6.76□□□□□ -1.33
RRN11Q04712 SML1YML058W 315 nt6.76□□□□□ -1.33
RRN11Q04712 GET4YOR164C 939 nt6.76□□□□□ -1.33
RRN11Q04712 BRN1YBL097W 2265 nt6.76□□□□□ -1.33
RRN11Q04712 SRF1YDL133W 1314 nt6.76□□□□□ -1.33
RRN11Q04712 SEC24YIL109C 2781 nt6.74□□□□□ -1.33
RRN11Q04712 HNM1YGL077C 1692 nt6.74□□□□□ -1.33
RRN11Q04712 YKR023WYKR023W 1593 nt6.74□□□□□ -1.33
RRN11Q04712 TOD6YBL054W 1578 nt6.74□□□□□ -1.33
RRN11Q04712 HXK2YGL253W 1461 nt6.74□□□□□ -1.33
RRN11Q04712 RBS1YDL189W 1374 nt6.74□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 53.8 ms