Protein–RNA interactions for Protein: Q03395

ROM1, Rod outer segment membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROM1Q03395 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ROM1Q03395 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ROM1Q03395 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ROM1Q03395 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ROM1Q03395 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ROM1Q03395 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ROM1Q03395 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ROM1Q03395 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ROM1Q03395 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ROM1Q03395 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ROM1Q03395 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ROM1Q03395 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ROM1Q03395 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ROM1Q03395 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ROM1Q03395 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ROM1Q03395 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ROM1Q03395 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ROM1Q03395 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ROM1Q03395 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ROM1Q03395 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ROM1Q03395 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ROM1Q03395 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ROM1Q03395 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ROM1Q03395 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ROM1Q03395 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ROM1Q03395 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ROM1Q03395 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ROM1Q03395 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ROM1Q03395 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ROM1Q03395 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ROM1Q03395 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ROM1Q03395 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ROM1Q03395 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ROM1Q03395 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ROM1Q03395 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ROM1Q03395 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ROM1Q03395 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ROM1Q03395 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ROM1Q03395 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ROM1Q03395 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ROM1Q03395 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ROM1Q03395 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ROM1Q03395 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ROM1Q03395 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ROM1Q03395 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ROM1Q03395 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ROM1Q03395 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ROM1Q03395 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ROM1Q03395 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ROM1Q03395 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ROM1Q03395 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ROM1Q03395 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ROM1Q03395 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ROM1Q03395 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ROM1Q03395 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ROM1Q03395 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ROM1Q03395 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ROM1Q03395 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ROM1Q03395 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ROM1Q03395 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ROM1Q03395 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ROM1Q03395 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ROM1Q03395 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ROM1Q03395 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ROM1Q03395 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ROM1Q03395 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ROM1Q03395 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ROM1Q03395 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ROM1Q03395 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ROM1Q03395 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ROM1Q03395 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ROM1Q03395 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ROM1Q03395 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ROM1Q03395 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ROM1Q03395 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ROM1Q03395 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ROM1Q03395 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ROM1Q03395 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ROM1Q03395 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ROM1Q03395 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ROM1Q03395 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ROM1Q03395 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ROM1Q03395 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ROM1Q03395 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ROM1Q03395 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ROM1Q03395 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ROM1Q03395 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ROM1Q03395 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ROM1Q03395 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ROM1Q03395 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ROM1Q03395 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ROM1Q03395 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ROM1Q03395 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ROM1Q03395 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ROM1Q03395 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ROM1Q03395 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ROM1Q03395 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ROM1Q03395 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ROM1Q03395 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ROM1Q03395 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1118 ms