Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CACNB1Q02641 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CACNB1Q02641 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CACNB1Q02641 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CACNB1Q02641 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CACNB1Q02641 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CACNB1Q02641 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CACNB1Q02641 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CACNB1Q02641 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CACNB1Q02641 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CACNB1Q02641 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CACNB1Q02641 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CACNB1Q02641 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CACNB1Q02641 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CACNB1Q02641 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CACNB1Q02641 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CACNB1Q02641 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CACNB1Q02641 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CACNB1Q02641 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CACNB1Q02641 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CACNB1Q02641 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CACNB1Q02641 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CACNB1Q02641 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CACNB1Q02641 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CACNB1Q02641 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CACNB1Q02641 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CACNB1Q02641 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CACNB1Q02641 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CACNB1Q02641 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CACNB1Q02641 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CACNB1Q02641 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CACNB1Q02641 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CACNB1Q02641 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CACNB1Q02641 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CACNB1Q02641 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CACNB1Q02641 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CACNB1Q02641 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CACNB1Q02641 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CACNB1Q02641 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CACNB1Q02641 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CACNB1Q02641 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CACNB1Q02641 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CACNB1Q02641 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CACNB1Q02641 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CACNB1Q02641 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CACNB1Q02641 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CACNB1Q02641 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CACNB1Q02641 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CACNB1Q02641 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CACNB1Q02641 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CACNB1Q02641 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CACNB1Q02641 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CACNB1Q02641 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CACNB1Q02641 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CACNB1Q02641 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CACNB1Q02641 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CACNB1Q02641 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CACNB1Q02641 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CACNB1Q02641 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CACNB1Q02641 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CACNB1Q02641 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CACNB1Q02641 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CACNB1Q02641 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CACNB1Q02641 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CACNB1Q02641 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CACNB1Q02641 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CACNB1Q02641 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CACNB1Q02641 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CACNB1Q02641 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CACNB1Q02641 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CACNB1Q02641 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CACNB1Q02641 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CACNB1Q02641 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CACNB1Q02641 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CACNB1Q02641 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CACNB1Q02641 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CACNB1Q02641 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CACNB1Q02641 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CACNB1Q02641 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CACNB1Q02641 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CACNB1Q02641 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CACNB1Q02641 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CACNB1Q02641 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CACNB1Q02641 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CACNB1Q02641 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CACNB1Q02641 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CACNB1Q02641 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CACNB1Q02641 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CACNB1Q02641 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CACNB1Q02641 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CACNB1Q02641 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CACNB1Q02641 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CACNB1Q02641 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CACNB1Q02641 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CACNB1Q02641 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CACNB1Q02641 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CACNB1Q02641 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CACNB1Q02641 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CACNB1Q02641 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CACNB1Q02641 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms