Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CYP27A1Q02318 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CYP27A1Q02318 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CYP27A1Q02318 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CYP27A1Q02318 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CYP27A1Q02318 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CYP27A1Q02318 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CYP27A1Q02318 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CYP27A1Q02318 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CYP27A1Q02318 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CYP27A1Q02318 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CYP27A1Q02318 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CYP27A1Q02318 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CYP27A1Q02318 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CYP27A1Q02318 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CYP27A1Q02318 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CYP27A1Q02318 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CYP27A1Q02318 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CYP27A1Q02318 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CYP27A1Q02318 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CYP27A1Q02318 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CYP27A1Q02318 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CYP27A1Q02318 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CYP27A1Q02318 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CYP27A1Q02318 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CYP27A1Q02318 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CYP27A1Q02318 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CYP27A1Q02318 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CYP27A1Q02318 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CYP27A1Q02318 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CYP27A1Q02318 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CYP27A1Q02318 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CYP27A1Q02318 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CYP27A1Q02318 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CYP27A1Q02318 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CYP27A1Q02318 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CYP27A1Q02318 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CYP27A1Q02318 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CYP27A1Q02318 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CYP27A1Q02318 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CYP27A1Q02318 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CYP27A1Q02318 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CYP27A1Q02318 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CYP27A1Q02318 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CYP27A1Q02318 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CYP27A1Q02318 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CYP27A1Q02318 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CYP27A1Q02318 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CYP27A1Q02318 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYP27A1Q02318 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CYP27A1Q02318 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CYP27A1Q02318 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CYP27A1Q02318 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CYP27A1Q02318 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CYP27A1Q02318 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CYP27A1Q02318 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CYP27A1Q02318 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CYP27A1Q02318 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CYP27A1Q02318 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CYP27A1Q02318 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CYP27A1Q02318 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CYP27A1Q02318 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CYP27A1Q02318 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CYP27A1Q02318 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CYP27A1Q02318 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CYP27A1Q02318 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CYP27A1Q02318 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CYP27A1Q02318 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CYP27A1Q02318 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CYP27A1Q02318 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CYP27A1Q02318 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CYP27A1Q02318 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CYP27A1Q02318 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CYP27A1Q02318 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CYP27A1Q02318 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CYP27A1Q02318 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CYP27A1Q02318 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CYP27A1Q02318 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CYP27A1Q02318 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CYP27A1Q02318 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CYP27A1Q02318 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CYP27A1Q02318 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CYP27A1Q02318 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CYP27A1Q02318 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CYP27A1Q02318 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CYP27A1Q02318 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CYP27A1Q02318 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CYP27A1Q02318 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CYP27A1Q02318 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CYP27A1Q02318 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CYP27A1Q02318 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CYP27A1Q02318 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CYP27A1Q02318 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CYP27A1Q02318 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CYP27A1Q02318 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
CYP27A1Q02318 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CYP27A1Q02318 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CYP27A1Q02318 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CYP27A1Q02318 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CYP27A1Q02318 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms