Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNTN2Q02246 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNTN2Q02246 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNTN2Q02246 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNTN2Q02246 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CNTN2Q02246 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CNTN2Q02246 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CNTN2Q02246 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CNTN2Q02246 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CNTN2Q02246 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CNTN2Q02246 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CNTN2Q02246 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CNTN2Q02246 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CNTN2Q02246 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CNTN2Q02246 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CNTN2Q02246 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CNTN2Q02246 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CNTN2Q02246 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CNTN2Q02246 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CNTN2Q02246 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CNTN2Q02246 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CNTN2Q02246 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CNTN2Q02246 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CNTN2Q02246 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CNTN2Q02246 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CNTN2Q02246 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CNTN2Q02246 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CNTN2Q02246 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CNTN2Q02246 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CNTN2Q02246 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CNTN2Q02246 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
CNTN2Q02246 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CNTN2Q02246 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CNTN2Q02246 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CNTN2Q02246 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CNTN2Q02246 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CNTN2Q02246 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CNTN2Q02246 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CNTN2Q02246 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CNTN2Q02246 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CNTN2Q02246 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CNTN2Q02246 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CNTN2Q02246 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CNTN2Q02246 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CNTN2Q02246 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CNTN2Q02246 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CNTN2Q02246 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CNTN2Q02246 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CNTN2Q02246 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CNTN2Q02246 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CNTN2Q02246 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CNTN2Q02246 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CNTN2Q02246 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNTN2Q02246 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNTN2Q02246 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNTN2Q02246 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNTN2Q02246 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNTN2Q02246 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CNTN2Q02246 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CNTN2Q02246 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNTN2Q02246 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNTN2Q02246 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CNTN2Q02246 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CNTN2Q02246 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CNTN2Q02246 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CNTN2Q02246 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CNTN2Q02246 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CNTN2Q02246 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CNTN2Q02246 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CNTN2Q02246 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CNTN2Q02246 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CNTN2Q02246 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CNTN2Q02246 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CNTN2Q02246 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CNTN2Q02246 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CNTN2Q02246 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNTN2Q02246 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNTN2Q02246 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNTN2Q02246 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CNTN2Q02246 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNTN2Q02246 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNTN2Q02246 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNTN2Q02246 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNTN2Q02246 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNTN2Q02246 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CNTN2Q02246 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNTN2Q02246 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNTN2Q02246 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNTN2Q02246 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNTN2Q02246 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNTN2Q02246 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNTN2Q02246 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CNTN2Q02246 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CNTN2Q02246 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CNTN2Q02246 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNTN2Q02246 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CNTN2Q02246 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNTN2Q02246 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CNTN2Q02246 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CNTN2Q02246 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms