Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK6Q00534 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK6Q00534 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK6Q00534 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK6Q00534 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK6Q00534 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK6Q00534 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK6Q00534 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK6Q00534 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK6Q00534 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK6Q00534 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK6Q00534 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK6Q00534 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK6Q00534 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK6Q00534 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK6Q00534 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK6Q00534 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK6Q00534 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK6Q00534 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK6Q00534 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK6Q00534 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK6Q00534 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK6Q00534 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CDK6Q00534 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK6Q00534 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK6Q00534 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK6Q00534 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK6Q00534 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK6Q00534 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK6Q00534 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK6Q00534 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK6Q00534 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK6Q00534 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK6Q00534 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK6Q00534 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK6Q00534 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK6Q00534 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK6Q00534 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK6Q00534 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK6Q00534 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK6Q00534 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK6Q00534 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK6Q00534 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK6Q00534 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK6Q00534 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK6Q00534 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK6Q00534 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK6Q00534 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK6Q00534 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK6Q00534 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK6Q00534 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK6Q00534 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK6Q00534 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDK6Q00534 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDK6Q00534 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK6Q00534 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK6Q00534 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK6Q00534 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK6Q00534 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK6Q00534 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK6Q00534 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK6Q00534 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK6Q00534 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK6Q00534 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK6Q00534 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK6Q00534 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK6Q00534 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK6Q00534 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK6Q00534 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK6Q00534 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK6Q00534 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK6Q00534 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK6Q00534 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK6Q00534 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK6Q00534 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK6Q00534 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK6Q00534 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK6Q00534 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK6Q00534 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDK6Q00534 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDK6Q00534 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK6Q00534 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK6Q00534 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK6Q00534 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK6Q00534 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK6Q00534 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK6Q00534 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK6Q00534 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK6Q00534 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK6Q00534 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK6Q00534 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK6Q00534 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK6Q00534 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK6Q00534 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK6Q00534 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK6Q00534 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK6Q00534 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK6Q00534 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK6Q00534 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK6Q00534 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms