Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VLDLRP98155 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VLDLRP98155 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VLDLRP98155 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VLDLRP98155 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VLDLRP98155 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VLDLRP98155 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
VLDLRP98155 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VLDLRP98155 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VLDLRP98155 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VLDLRP98155 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VLDLRP98155 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
VLDLRP98155 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VLDLRP98155 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VLDLRP98155 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VLDLRP98155 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
VLDLRP98155 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VLDLRP98155 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VLDLRP98155 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VLDLRP98155 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VLDLRP98155 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VLDLRP98155 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VLDLRP98155 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VLDLRP98155 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
VLDLRP98155 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VLDLRP98155 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VLDLRP98155 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VLDLRP98155 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VLDLRP98155 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
VLDLRP98155 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VLDLRP98155 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
VLDLRP98155 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VLDLRP98155 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VLDLRP98155 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VLDLRP98155 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VLDLRP98155 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VLDLRP98155 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VLDLRP98155 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VLDLRP98155 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VLDLRP98155 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VLDLRP98155 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VLDLRP98155 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VLDLRP98155 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VLDLRP98155 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VLDLRP98155 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VLDLRP98155 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VLDLRP98155 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VLDLRP98155 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VLDLRP98155 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VLDLRP98155 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
VLDLRP98155 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VLDLRP98155 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
VLDLRP98155 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VLDLRP98155 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VLDLRP98155 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VLDLRP98155 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VLDLRP98155 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
VLDLRP98155 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VLDLRP98155 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VLDLRP98155 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VLDLRP98155 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VLDLRP98155 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VLDLRP98155 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VLDLRP98155 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VLDLRP98155 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VLDLRP98155 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VLDLRP98155 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VLDLRP98155 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VLDLRP98155 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VLDLRP98155 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VLDLRP98155 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VLDLRP98155 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VLDLRP98155 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VLDLRP98155 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VLDLRP98155 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VLDLRP98155 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VLDLRP98155 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VLDLRP98155 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VLDLRP98155 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VLDLRP98155 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VLDLRP98155 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VLDLRP98155 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VLDLRP98155 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VLDLRP98155 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VLDLRP98155 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
VLDLRP98155 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VLDLRP98155 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VLDLRP98155 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
VLDLRP98155 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VLDLRP98155 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VLDLRP98155 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VLDLRP98155 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
VLDLRP98155 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VLDLRP98155 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VLDLRP98155 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VLDLRP98155 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VLDLRP98155 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VLDLRP98155 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VLDLRP98155 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VLDLRP98155 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms