Protein–RNA interactions for Protein: P69849

NOMO3, Nodal modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3P69849 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NOMO3P69849 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NOMO3P69849 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NOMO3P69849 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NOMO3P69849 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NOMO3P69849 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NOMO3P69849 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NOMO3P69849 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NOMO3P69849 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NOMO3P69849 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NOMO3P69849 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NOMO3P69849 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NOMO3P69849 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NOMO3P69849 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NOMO3P69849 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NOMO3P69849 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NOMO3P69849 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NOMO3P69849 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NOMO3P69849 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NOMO3P69849 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NOMO3P69849 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NOMO3P69849 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NOMO3P69849 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NOMO3P69849 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NOMO3P69849 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NOMO3P69849 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NOMO3P69849 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NOMO3P69849 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NOMO3P69849 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NOMO3P69849 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NOMO3P69849 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NOMO3P69849 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NOMO3P69849 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NOMO3P69849 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NOMO3P69849 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NOMO3P69849 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NOMO3P69849 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NOMO3P69849 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
NOMO3P69849 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NOMO3P69849 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
NOMO3P69849 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NOMO3P69849 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NOMO3P69849 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NOMO3P69849 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NOMO3P69849 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NOMO3P69849 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NOMO3P69849 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NOMO3P69849 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NOMO3P69849 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NOMO3P69849 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NOMO3P69849 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NOMO3P69849 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NOMO3P69849 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NOMO3P69849 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NOMO3P69849 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NOMO3P69849 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NOMO3P69849 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NOMO3P69849 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NOMO3P69849 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NOMO3P69849 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NOMO3P69849 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NOMO3P69849 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NOMO3P69849 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NOMO3P69849 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NOMO3P69849 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NOMO3P69849 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NOMO3P69849 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NOMO3P69849 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NOMO3P69849 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NOMO3P69849 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
NOMO3P69849 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NOMO3P69849 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NOMO3P69849 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
NOMO3P69849 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NOMO3P69849 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
NOMO3P69849 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NOMO3P69849 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NOMO3P69849 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NOMO3P69849 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NOMO3P69849 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NOMO3P69849 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NOMO3P69849 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NOMO3P69849 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NOMO3P69849 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NOMO3P69849 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NOMO3P69849 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NOMO3P69849 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NOMO3P69849 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NOMO3P69849 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NOMO3P69849 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NOMO3P69849 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NOMO3P69849 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NOMO3P69849 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NOMO3P69849 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NOMO3P69849 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NOMO3P69849 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NOMO3P69849 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
NOMO3P69849 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NOMO3P69849 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NOMO3P69849 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms