Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTA1P68133 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTA1P68133 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTA1P68133 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTA1P68133 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTA1P68133 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTA1P68133 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTA1P68133 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTA1P68133 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTA1P68133 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTA1P68133 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTA1P68133 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTA1P68133 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTA1P68133 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTA1P68133 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTA1P68133 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTA1P68133 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTA1P68133 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTA1P68133 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTA1P68133 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTA1P68133 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTA1P68133 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTA1P68133 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTA1P68133 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTA1P68133 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTA1P68133 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTA1P68133 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTA1P68133 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTA1P68133 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTA1P68133 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACTA1P68133 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTA1P68133 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTA1P68133 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTA1P68133 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTA1P68133 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTA1P68133 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTA1P68133 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTA1P68133 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTA1P68133 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTA1P68133 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTA1P68133 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTA1P68133 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTA1P68133 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTA1P68133 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTA1P68133 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTA1P68133 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTA1P68133 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTA1P68133 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTA1P68133 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTA1P68133 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTA1P68133 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTA1P68133 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTA1P68133 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTA1P68133 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTA1P68133 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTA1P68133 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTA1P68133 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTA1P68133 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTA1P68133 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTA1P68133 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTA1P68133 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTA1P68133 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTA1P68133 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTA1P68133 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTA1P68133 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTA1P68133 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ACTA1P68133 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ACTA1P68133 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ACTA1P68133 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACTA1P68133 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTA1P68133 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ACTA1P68133 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTA1P68133 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTA1P68133 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTA1P68133 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTA1P68133 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTA1P68133 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTA1P68133 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTA1P68133 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTA1P68133 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTA1P68133 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTA1P68133 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTA1P68133 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTA1P68133 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTA1P68133 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTA1P68133 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTA1P68133 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTA1P68133 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTA1P68133 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTA1P68133 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTA1P68133 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTA1P68133 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTA1P68133 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTA1P68133 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTA1P68133 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTA1P68133 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTA1P68133 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTA1P68133 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTA1P68133 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTA1P68133 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.2 ms