Protein–RNA interactions for Protein: P63279

UBE2I, SUMO-conjugating enzyme UBC9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2IP63279 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE2IP63279 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE2IP63279 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE2IP63279 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2IP63279 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2IP63279 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2IP63279 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2IP63279 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE2IP63279 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE2IP63279 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE2IP63279 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE2IP63279 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE2IP63279 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE2IP63279 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE2IP63279 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE2IP63279 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE2IP63279 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE2IP63279 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE2IP63279 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE2IP63279 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE2IP63279 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE2IP63279 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE2IP63279 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE2IP63279 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE2IP63279 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE2IP63279 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE2IP63279 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE2IP63279 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE2IP63279 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE2IP63279 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE2IP63279 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE2IP63279 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE2IP63279 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE2IP63279 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE2IP63279 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE2IP63279 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE2IP63279 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE2IP63279 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE2IP63279 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE2IP63279 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE2IP63279 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE2IP63279 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE2IP63279 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE2IP63279 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE2IP63279 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE2IP63279 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE2IP63279 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE2IP63279 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE2IP63279 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE2IP63279 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE2IP63279 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE2IP63279 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE2IP63279 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE2IP63279 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE2IP63279 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE2IP63279 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE2IP63279 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE2IP63279 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBE2IP63279 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE2IP63279 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE2IP63279 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE2IP63279 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE2IP63279 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE2IP63279 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE2IP63279 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBE2IP63279 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE2IP63279 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE2IP63279 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE2IP63279 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBE2IP63279 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBE2IP63279 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBE2IP63279 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE2IP63279 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE2IP63279 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE2IP63279 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBE2IP63279 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE2IP63279 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBE2IP63279 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE2IP63279 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE2IP63279 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE2IP63279 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE2IP63279 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE2IP63279 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
UBE2IP63279 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE2IP63279 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE2IP63279 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE2IP63279 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE2IP63279 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE2IP63279 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE2IP63279 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE2IP63279 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE2IP63279 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE2IP63279 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE2IP63279 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE2IP63279 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE2IP63279 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE2IP63279 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE2IP63279 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE2IP63279 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE2IP63279 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms