Protein–RNA interactions for Protein: P62333

PSMC6, 26S proteasome regulatory subunit 10B, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC6P62333 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PSMC6P62333 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PSMC6P62333 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PSMC6P62333 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PSMC6P62333 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PSMC6P62333 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PSMC6P62333 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PSMC6P62333 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PSMC6P62333 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PSMC6P62333 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PSMC6P62333 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PSMC6P62333 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PSMC6P62333 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PSMC6P62333 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PSMC6P62333 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PSMC6P62333 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSMC6P62333 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PSMC6P62333 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PSMC6P62333 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PSMC6P62333 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PSMC6P62333 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PSMC6P62333 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSMC6P62333 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PSMC6P62333 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PSMC6P62333 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PSMC6P62333 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PSMC6P62333 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PSMC6P62333 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PSMC6P62333 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PSMC6P62333 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PSMC6P62333 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PSMC6P62333 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PSMC6P62333 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PSMC6P62333 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PSMC6P62333 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSMC6P62333 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSMC6P62333 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PSMC6P62333 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSMC6P62333 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSMC6P62333 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSMC6P62333 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSMC6P62333 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PSMC6P62333 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSMC6P62333 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSMC6P62333 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSMC6P62333 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSMC6P62333 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSMC6P62333 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSMC6P62333 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSMC6P62333 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSMC6P62333 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSMC6P62333 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSMC6P62333 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSMC6P62333 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSMC6P62333 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSMC6P62333 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PSMC6P62333 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PSMC6P62333 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PSMC6P62333 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PSMC6P62333 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PSMC6P62333 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PSMC6P62333 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PSMC6P62333 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PSMC6P62333 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PSMC6P62333 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PSMC6P62333 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PSMC6P62333 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PSMC6P62333 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PSMC6P62333 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PSMC6P62333 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PSMC6P62333 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PSMC6P62333 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PSMC6P62333 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PSMC6P62333 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PSMC6P62333 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PSMC6P62333 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PSMC6P62333 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PSMC6P62333 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PSMC6P62333 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PSMC6P62333 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PSMC6P62333 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PSMC6P62333 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PSMC6P62333 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PSMC6P62333 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PSMC6P62333 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSMC6P62333 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSMC6P62333 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSMC6P62333 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSMC6P62333 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PSMC6P62333 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PSMC6P62333 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PSMC6P62333 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PSMC6P62333 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PSMC6P62333 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PSMC6P62333 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PSMC6P62333 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PSMC6P62333 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PSMC6P62333 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PSMC6P62333 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PSMC6P62333 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms