Protein–RNA interactions for Protein: P61962

DCAF7, DDB1- and CUL4-associated factor 7, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF7P61962 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCAF7P61962 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCAF7P61962 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCAF7P61962 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCAF7P61962 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCAF7P61962 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCAF7P61962 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCAF7P61962 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCAF7P61962 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCAF7P61962 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCAF7P61962 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCAF7P61962 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCAF7P61962 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCAF7P61962 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCAF7P61962 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCAF7P61962 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCAF7P61962 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCAF7P61962 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCAF7P61962 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCAF7P61962 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCAF7P61962 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCAF7P61962 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCAF7P61962 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCAF7P61962 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCAF7P61962 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCAF7P61962 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCAF7P61962 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCAF7P61962 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DCAF7P61962 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCAF7P61962 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCAF7P61962 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DCAF7P61962 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DCAF7P61962 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCAF7P61962 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCAF7P61962 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCAF7P61962 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCAF7P61962 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCAF7P61962 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCAF7P61962 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCAF7P61962 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCAF7P61962 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCAF7P61962 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCAF7P61962 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DCAF7P61962 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCAF7P61962 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCAF7P61962 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCAF7P61962 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCAF7P61962 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCAF7P61962 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCAF7P61962 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCAF7P61962 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCAF7P61962 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCAF7P61962 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCAF7P61962 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCAF7P61962 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCAF7P61962 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCAF7P61962 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCAF7P61962 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCAF7P61962 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCAF7P61962 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCAF7P61962 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCAF7P61962 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DCAF7P61962 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DCAF7P61962 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DCAF7P61962 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCAF7P61962 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCAF7P61962 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCAF7P61962 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCAF7P61962 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCAF7P61962 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCAF7P61962 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCAF7P61962 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCAF7P61962 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCAF7P61962 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCAF7P61962 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCAF7P61962 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
DCAF7P61962 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCAF7P61962 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCAF7P61962 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCAF7P61962 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCAF7P61962 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCAF7P61962 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCAF7P61962 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCAF7P61962 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCAF7P61962 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCAF7P61962 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCAF7P61962 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCAF7P61962 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCAF7P61962 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCAF7P61962 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCAF7P61962 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCAF7P61962 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCAF7P61962 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCAF7P61962 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCAF7P61962 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCAF7P61962 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCAF7P61962 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCAF7P61962 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCAF7P61962 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCAF7P61962 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms