Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERVFC1P60507 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERVFC1P60507 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERVFC1P60507 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERVFC1P60507 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERVFC1P60507 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERVFC1P60507 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERVFC1P60507 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ERVFC1P60507 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERVFC1P60507 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERVFC1P60507 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERVFC1P60507 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERVFC1P60507 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERVFC1P60507 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERVFC1P60507 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ERVFC1P60507 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERVFC1P60507 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ERVFC1P60507 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ERVFC1P60507 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERVFC1P60507 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERVFC1P60507 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERVFC1P60507 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERVFC1P60507 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ERVFC1P60507 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERVFC1P60507 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERVFC1P60507 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERVFC1P60507 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERVFC1P60507 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERVFC1P60507 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERVFC1P60507 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ERVFC1P60507 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ERVFC1P60507 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
ERVFC1P60507 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ERVFC1P60507 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ERVFC1P60507 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ERVFC1P60507 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ERVFC1P60507 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ERVFC1P60507 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERVFC1P60507 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERVFC1P60507 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERVFC1P60507 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERVFC1P60507 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERVFC1P60507 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERVFC1P60507 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ERVFC1P60507 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERVFC1P60507 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERVFC1P60507 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERVFC1P60507 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERVFC1P60507 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERVFC1P60507 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERVFC1P60507 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERVFC1P60507 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ERVFC1P60507 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERVFC1P60507 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERVFC1P60507 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERVFC1P60507 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERVFC1P60507 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERVFC1P60507 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERVFC1P60507 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERVFC1P60507 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERVFC1P60507 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERVFC1P60507 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ERVFC1P60507 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERVFC1P60507 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERVFC1P60507 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERVFC1P60507 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERVFC1P60507 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERVFC1P60507 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERVFC1P60507 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERVFC1P60507 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERVFC1P60507 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERVFC1P60507 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERVFC1P60507 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERVFC1P60507 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERVFC1P60507 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERVFC1P60507 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERVFC1P60507 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERVFC1P60507 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERVFC1P60507 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ERVFC1P60507 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERVFC1P60507 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERVFC1P60507 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERVFC1P60507 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERVFC1P60507 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERVFC1P60507 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERVFC1P60507 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERVFC1P60507 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERVFC1P60507 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERVFC1P60507 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERVFC1P60507 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERVFC1P60507 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERVFC1P60507 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERVFC1P60507 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERVFC1P60507 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVFC1P60507 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVFC1P60507 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVFC1P60507 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVFC1P60507 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVFC1P60507 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVFC1P60507 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms