Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNX16P57768 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNX16P57768 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNX16P57768 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNX16P57768 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNX16P57768 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNX16P57768 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNX16P57768 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNX16P57768 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNX16P57768 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNX16P57768 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX16P57768 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX16P57768 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX16P57768 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX16P57768 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX16P57768 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX16P57768 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX16P57768 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNX16P57768 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNX16P57768 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX16P57768 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX16P57768 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX16P57768 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX16P57768 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX16P57768 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX16P57768 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX16P57768 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX16P57768 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX16P57768 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX16P57768 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX16P57768 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX16P57768 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX16P57768 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX16P57768 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNX16P57768 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNX16P57768 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNX16P57768 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNX16P57768 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX16P57768 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX16P57768 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX16P57768 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX16P57768 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNX16P57768 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNX16P57768 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNX16P57768 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNX16P57768 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNX16P57768 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNX16P57768 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNX16P57768 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNX16P57768 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNX16P57768 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNX16P57768 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SNX16P57768 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX16P57768 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX16P57768 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX16P57768 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SNX16P57768 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNX16P57768 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNX16P57768 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNX16P57768 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNX16P57768 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX16P57768 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX16P57768 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX16P57768 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX16P57768 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX16P57768 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX16P57768 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX16P57768 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX16P57768 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX16P57768 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX16P57768 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX16P57768 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX16P57768 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX16P57768 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX16P57768 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX16P57768 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX16P57768 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX16P57768 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX16P57768 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX16P57768 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX16P57768 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX16P57768 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX16P57768 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX16P57768 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX16P57768 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX16P57768 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX16P57768 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX16P57768 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX16P57768 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX16P57768 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX16P57768 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX16P57768 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX16P57768 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNX16P57768 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNX16P57768 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNX16P57768 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SNX16P57768 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SNX16P57768 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNX16P57768 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNX16P57768 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms