Protein–RNA interactions for Protein: P57739

CLDN2, Claudin-2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN2P57739 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLDN2P57739 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLDN2P57739 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CLDN2P57739 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLDN2P57739 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLDN2P57739 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLDN2P57739 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLDN2P57739 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLDN2P57739 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLDN2P57739 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLDN2P57739 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLDN2P57739 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLDN2P57739 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLDN2P57739 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLDN2P57739 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLDN2P57739 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLDN2P57739 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLDN2P57739 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CLDN2P57739 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLDN2P57739 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLDN2P57739 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLDN2P57739 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLDN2P57739 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLDN2P57739 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLDN2P57739 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CLDN2P57739 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLDN2P57739 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLDN2P57739 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CLDN2P57739 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLDN2P57739 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLDN2P57739 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLDN2P57739 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLDN2P57739 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLDN2P57739 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLDN2P57739 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLDN2P57739 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CLDN2P57739 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLDN2P57739 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLDN2P57739 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLDN2P57739 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLDN2P57739 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLDN2P57739 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLDN2P57739 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLDN2P57739 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLDN2P57739 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLDN2P57739 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLDN2P57739 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLDN2P57739 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLDN2P57739 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CLDN2P57739 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLDN2P57739 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLDN2P57739 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLDN2P57739 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLDN2P57739 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CLDN2P57739 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLDN2P57739 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLDN2P57739 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLDN2P57739 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLDN2P57739 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLDN2P57739 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLDN2P57739 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLDN2P57739 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLDN2P57739 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLDN2P57739 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLDN2P57739 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLDN2P57739 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLDN2P57739 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLDN2P57739 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLDN2P57739 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLDN2P57739 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CLDN2P57739 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLDN2P57739 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLDN2P57739 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLDN2P57739 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLDN2P57739 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CLDN2P57739 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLDN2P57739 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLDN2P57739 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLDN2P57739 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLDN2P57739 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLDN2P57739 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLDN2P57739 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLDN2P57739 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLDN2P57739 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLDN2P57739 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLDN2P57739 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CLDN2P57739 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLDN2P57739 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CLDN2P57739 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CLDN2P57739 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLDN2P57739 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLDN2P57739 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLDN2P57739 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLDN2P57739 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CLDN2P57739 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLDN2P57739 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLDN2P57739 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CLDN2P57739 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLDN2P57739 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLDN2P57739 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms