Protein–RNA interactions for Protein: P56715

RP1, Oxygen-regulated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP1P56715 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RP1P56715 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RP1P56715 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RP1P56715 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RP1P56715 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RP1P56715 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RP1P56715 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RP1P56715 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RP1P56715 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RP1P56715 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RP1P56715 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RP1P56715 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RP1P56715 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RP1P56715 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RP1P56715 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RP1P56715 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RP1P56715 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RP1P56715 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RP1P56715 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RP1P56715 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RP1P56715 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RP1P56715 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RP1P56715 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RP1P56715 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RP1P56715 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RP1P56715 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
RP1P56715 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RP1P56715 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RP1P56715 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RP1P56715 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RP1P56715 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RP1P56715 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RP1P56715 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RP1P56715 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RP1P56715 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RP1P56715 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RP1P56715 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RP1P56715 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RP1P56715 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RP1P56715 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RP1P56715 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RP1P56715 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RP1P56715 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RP1P56715 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RP1P56715 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RP1P56715 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RP1P56715 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RP1P56715 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RP1P56715 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RP1P56715 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RP1P56715 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RP1P56715 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RP1P56715 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RP1P56715 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RP1P56715 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RP1P56715 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RP1P56715 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RP1P56715 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RP1P56715 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RP1P56715 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RP1P56715 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RP1P56715 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RP1P56715 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RP1P56715 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RP1P56715 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RP1P56715 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RP1P56715 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RP1P56715 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RP1P56715 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RP1P56715 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RP1P56715 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RP1P56715 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RP1P56715 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RP1P56715 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RP1P56715 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RP1P56715 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RP1P56715 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RP1P56715 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RP1P56715 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RP1P56715 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RP1P56715 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RP1P56715 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RP1P56715 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RP1P56715 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RP1P56715 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RP1P56715 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RP1P56715 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RP1P56715 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RP1P56715 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RP1P56715 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RP1P56715 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RP1P56715 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RP1P56715 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RP1P56715 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RP1P56715 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RP1P56715 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RP1P56715 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RP1P56715 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RP1P56715 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RP1P56715 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms