Protein–RNA interactions for Protein: P56559

ARL4C, ADP-ribosylation factor-like protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4CP56559 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARL4CP56559 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ARL4CP56559 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARL4CP56559 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARL4CP56559 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARL4CP56559 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARL4CP56559 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARL4CP56559 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARL4CP56559 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARL4CP56559 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARL4CP56559 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARL4CP56559 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARL4CP56559 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARL4CP56559 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARL4CP56559 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARL4CP56559 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARL4CP56559 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARL4CP56559 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARL4CP56559 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARL4CP56559 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARL4CP56559 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ARL4CP56559 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARL4CP56559 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARL4CP56559 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARL4CP56559 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ARL4CP56559 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ARL4CP56559 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARL4CP56559 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARL4CP56559 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARL4CP56559 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARL4CP56559 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARL4CP56559 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARL4CP56559 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARL4CP56559 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARL4CP56559 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARL4CP56559 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARL4CP56559 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARL4CP56559 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARL4CP56559 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARL4CP56559 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARL4CP56559 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARL4CP56559 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARL4CP56559 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARL4CP56559 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARL4CP56559 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARL4CP56559 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARL4CP56559 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARL4CP56559 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARL4CP56559 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARL4CP56559 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ARL4CP56559 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARL4CP56559 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARL4CP56559 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARL4CP56559 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARL4CP56559 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARL4CP56559 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARL4CP56559 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ARL4CP56559 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARL4CP56559 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARL4CP56559 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARL4CP56559 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARL4CP56559 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ARL4CP56559 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARL4CP56559 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARL4CP56559 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARL4CP56559 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARL4CP56559 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARL4CP56559 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARL4CP56559 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARL4CP56559 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ARL4CP56559 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ARL4CP56559 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ARL4CP56559 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARL4CP56559 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARL4CP56559 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARL4CP56559 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARL4CP56559 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARL4CP56559 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARL4CP56559 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARL4CP56559 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARL4CP56559 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARL4CP56559 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARL4CP56559 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ARL4CP56559 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARL4CP56559 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARL4CP56559 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARL4CP56559 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARL4CP56559 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARL4CP56559 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARL4CP56559 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARL4CP56559 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARL4CP56559 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARL4CP56559 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARL4CP56559 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARL4CP56559 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARL4CP56559 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ARL4CP56559 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARL4CP56559 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARL4CP56559 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARL4CP56559 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms