Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTBP2P56545 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CTBP2P56545 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTBP2P56545 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTBP2P56545 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTBP2P56545 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTBP2P56545 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTBP2P56545 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTBP2P56545 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTBP2P56545 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTBP2P56545 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTBP2P56545 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTBP2P56545 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTBP2P56545 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTBP2P56545 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTBP2P56545 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTBP2P56545 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTBP2P56545 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTBP2P56545 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTBP2P56545 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTBP2P56545 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTBP2P56545 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTBP2P56545 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CTBP2P56545 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTBP2P56545 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTBP2P56545 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTBP2P56545 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTBP2P56545 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTBP2P56545 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTBP2P56545 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTBP2P56545 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTBP2P56545 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTBP2P56545 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTBP2P56545 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTBP2P56545 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTBP2P56545 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTBP2P56545 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTBP2P56545 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTBP2P56545 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTBP2P56545 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTBP2P56545 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTBP2P56545 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTBP2P56545 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTBP2P56545 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTBP2P56545 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTBP2P56545 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTBP2P56545 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTBP2P56545 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTBP2P56545 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTBP2P56545 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTBP2P56545 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTBP2P56545 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTBP2P56545 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTBP2P56545 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTBP2P56545 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTBP2P56545 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTBP2P56545 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTBP2P56545 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTBP2P56545 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTBP2P56545 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTBP2P56545 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTBP2P56545 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTBP2P56545 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTBP2P56545 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTBP2P56545 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTBP2P56545 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTBP2P56545 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTBP2P56545 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTBP2P56545 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTBP2P56545 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTBP2P56545 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTBP2P56545 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTBP2P56545 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTBP2P56545 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTBP2P56545 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTBP2P56545 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTBP2P56545 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTBP2P56545 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTBP2P56545 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CTBP2P56545 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTBP2P56545 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTBP2P56545 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTBP2P56545 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTBP2P56545 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTBP2P56545 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTBP2P56545 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTBP2P56545 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTBP2P56545 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTBP2P56545 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTBP2P56545 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTBP2P56545 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTBP2P56545 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTBP2P56545 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTBP2P56545 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTBP2P56545 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTBP2P56545 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTBP2P56545 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTBP2P56545 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTBP2P56545 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTBP2P56545 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms